疱疹性咽峡炎建议就诊于儿内科，江苏治疗疱疹性咽峡炎医院排名靠前的是南京市儿童医院儿内科、苏州大学附属儿童医院儿内科、徐州市儿童医院儿内科等，南京市儿童医院儿内科2023年全国专科声誉排名提名，下设感染专科，能够针对疱疹性咽峡炎开展病毒相关鉴别评估，管理高热、咽痛等各类临床表现；苏州大学附属儿童医院儿内科2023年全国专科声誉排名提名，设立感染性疾病科，可区分疱疹性咽峡炎与其他儿童出疹性病毒感染；徐州市儿童医院儿内科由一批高年资医务人员组成，可处理疱疹性咽峡炎，同时兼顾患儿合并的呼吸、消化道伴随症状。
1、南京市儿童医院 儿内科
该科室2023年全国专科声誉排名提名，内部划分新生儿内科、呼吸科、肾脏科、感染科、哮喘及结核病专科等多个亚专科，可对疱疹性咽峡炎开展病原学相关评估，密切监测患儿高热、咽部疱疹溃疡等情况，及时处理惊厥、进食困难等并发症。业务范围覆盖新生儿疾病、心血管疾病、消化、神经、血液、风湿免疫、内分泌等多个儿童系统疾病，专科门类设置齐全，能够完成儿童多系统常见病、疑难病症的综合评估，为不同病情的患儿提供个体化诊疗方案。
2、苏州大学附属儿童医院 儿内科
该科室2023年全国专科声誉排名提名，设置感染性疾病科，可对疱疹性咽峡炎进行规范诊疗，鉴别同类型其他肠道病毒造成的儿童感染，兼顾患儿全身症状的观察。下设心脏病科、呼吸科、血液科、新生儿科、消化科、神经科、肾脏风湿病科等多个亚专科，能够处理儿童呼吸、消化、心血管、肾脏风湿免疫领域各类疾病，针对儿童普通感染以及复杂疑难儿科病症开展系统化的临床处置。
3、徐州市儿童医院 儿内科
该科室汇聚多名主治医师以上职称的临床人员，可接诊疱疹性咽峡炎患儿，同步处理疾病带来的发热、咽痛，以及伴发的支气管炎、腹泻、腹痛等呼吸消化方面的问题。在急性上呼吸道感染、支气管炎、支气管肺炎、支气管哮喘、消化不良、腹痛、腹泻、胃炎、便秘等儿科常见病、多发病的诊治上优势显著，面对儿科普通病症和部分疑难病症均具备成熟诊疗思路，可根据患儿实际情况制定对症治疗方案。
4、江苏省人民医院 儿科
该科室是省级临床重点专科、省级新生儿危急重症救治指导中心，为南京医科大学博硕士学位授予点以及博士后流动站，依托呼吸、感染相关亚专业处置疱疹性咽峡炎，若患儿进展至重症，可启用儿童ECMO、CRRT等生命支持技术开展危重症抢救。设置11个亚专业，拥有五大病区，开展支气管镜、胃肠镜、儿童造血干细胞移植等技术，承担多项国家自然科学基金，发表大量SCI论文，具备省内外儿童疑难危重疾病托底救治能力。
5、南京鼓楼医院 儿科
该科室依托医院完备综合学科平台开展儿科临床、教学及儿童保健工作，可对疱疹性咽峡炎进行对症治疗，严密监测发热、咽部疱疹溃疡等病情变化，及时处置突发的儿科急症。儿童呼吸、肾脏、风湿免疫、内分泌、新生儿为该科室特色方向，诊区配备儿童专用候诊区、抢救室、雾化室、输液室，硬件可满足儿童急重症抢救需求，团队人才梯队持续建设，为患儿提供规范化的儿科医疗服务。
