佳木斯大学附属口腔医院擅长的科室有口腔修复科、牙体牙髓病科、口腔颌面外科、口腔正畸科、儿童牙病科等。
1、口腔修复科
佳木斯大学附属口腔医院口腔修复科是医院成立最早、业务种类最齐全的科室之一，现已形成了完善的医疗教学体系，集医疗、教学、科研于一体，成为东北地区口腔修复治疗与教学的核心。科室拥有理论扎实、经验丰富的高素质临床医护人员，无论在修复数量、修复方法、修复效果上都在国内居于领先地位，达到较高的修复水平。多年来科室人员在国内各级刊物上发表论文数十篇、承担多个省级立项，同时已成为本地区口腔修复学重点的教学和实习基地。
2、牙体牙髓病科
佳木斯大学附属口腔医院牙体牙髓病科是集医疗、教学、科研于一体的临床科室，由一支专业化水平高、技术精湛、服务周到的医护队伍组成，技术力量雄厚、设备先进，主要负责龋病、非龋性疾病、牙髓病、根尖周疾病的诊断与治疗，尤其擅长牙髓炎、根尖周炎等引起牙齿急性疼痛的常见牙病，也擅长采用综合疗法治疗顽固性牙本质过敏症。
3、口腔颌面外科
佳木斯大学附属口腔医院口腔颌面外科的诊疗范围，主要包括骨折类疾病，例如颌骨骨折、颌面多发骨折；颌面部炎症，例如颌面部间隙感染、颌骨骨髓炎。此外，对于面颈部、口腔内各类肿物，例如痣、血管瘤等良性肿瘤，以及口腔癌、上颌窦癌等恶性肿瘤，均有较好的诊疗经验。有需要矫正牙齿的患者也可以到该科室就诊，其牙齿矫正的经验较为丰富。
4、口腔正畸科
佳木斯大学附属口腔医院口腔正畸科是一个拥有悠久历史和雄厚力量的科室，其凭借精湛的技术，无私的医德享誉三江，获得广大患者和家长的一致好评。主要承担牙列拥挤、反合、开合、上下颌前凸等错合畸形的诊断、预防及治疗任务，开展了国内外先进的矫治技术，同时进行个性化矫治设计，全面满足不同患者的矫治要求。每年治愈患者300余例，均收非常理想的效果。
5、儿童牙病科
佳木斯大学附属口腔医学院儿童牙病科拥有资深专家及硕士学位骨干医生，具有丰富的临床诊治经验，同时医疗设备齐全，擅长治疗十五岁以下儿童的龋病、牙髓病、根尖周病、外伤，并能进行牙齿发育期的咬合诱导以及预防乳牙、年轻恒牙的龋病、错合畸形等，疗效显著。