上海器官移植医院比较厉害的三个医院是上海交通大学医学院附属瑞金医院、上海长海医院器官、上海交通大学医学院附属新华医院。
上海交通大学医学院附属瑞金医院肾移植科是国内最早开展肾移植的单位之一，临床与科研实力雄厚。上海长海医院器官移植科移植技术国内领先，多器官移植综合实力突出。上海交通大学医学院附属新华医院移植科是国家级肝移植中心、国家临床重点专科，成人及儿童肝移植优势显著。
1、上海交通大学医学院附属瑞金医院 肾移植科
该科室是国内最早开展肾脏移植的单位之一，自70年代中期便开展同种肾脏移植，拥有徐达、王祥慧等国内知名专家，累计完成肾移植1600余例，最长存活时间达28年，短期及中期存活率达国际先进水平。诊疗范围涵盖活体亲属肾移植、高龄患者肾移植及多器官联合移植等。
临床设施齐全，科研成果丰硕，完成多项国家自然科学基金课题，获多项市级科技奖项，学术影响力突出。
2、上海长海医院 器官移植科
该科室自1978年完成首例肾移植、1996年完成首例肝移植以来，技术始终国内领先，2015年组建器官移植中心。学科拥有“长江学者”特聘教授等顶尖人才，部分专家担任国家级器官移植学会重要职务，可开展肾、肝、胰、心、肺等多器官移植及联合移植，婴幼儿供肾儿童肾移植例数居国内首位，科研实力强劲，获国家科技进步二等奖等多项荣誉。
3、上海交通大学医学院附属新华医院 移植科
该科室是全国首批国家级肝移植中心，2011年获评国家临床重点专科，已发展为集医教研于一体的大型器官移植中心。在学科带头人顾劲扬教授带领下，可同时完成成人及儿童肝移植，常规开展多种高难度肝移植术式，手术成功率及术后生存率均达国内领先水平，诊疗范围涵盖各类终末期肝病及肝胆肿瘤，术前评估与术后随访体系完善。
4、上海长征医院 肾移植科
该科室（器官移植中心）2003年成为解放军第一家器官移植研究所，是军队器官移植专业最高级别医教研集合体，1978年起开展肾移植，累计完成4900余例，小儿肾移植数量居国内第一。2016年开展胰岛移植，例数及疗效全国第一，可开展多类器官移植及联合移植，研制的器官保存液广泛应用于国内，获国家科技进步二等奖，是国家重点学科。
5、上海东方肝胆外科医院 器官移植科
该科室汇聚一批主治医师以上职称的资深医务人员，临床经验丰富，在器官移植领域特色鲜明、优势突出。科室擅长诊治器官移植相关常见病、多发病及疑难病症，尤其在肝癌、肝硬化、尿毒症、胆囊癌、胰头癌等疾病的移植治疗方面造诣深厚，凭借精湛的诊疗技术，为各类终末期器官疾病患者提供高质量的移植医疗服务，在业内享有一定声誉。
