巢湖肛肠科医院排名靠前的是安徽医科大学附属巢湖医院普通外科、合肥市第八人民医院肛肠科、巢湖市中医院中医外科等，安徽医科大学附属巢湖医院普通外科2019年成为中国NOSES联盟安徽分会副理事长单位，2020年成为安徽省疝与腹壁外科疾病联盟常务理事单位；合肥市第八人民医院肛肠科成立于1994年，现已成为本地具有影响力的特色专科；巢湖市中医院中医外科创建于1995年6月，医疗体系不断完善，专业队伍迅速扩大。
1、安徽医科大学附属巢湖医院 普通外科
该科室2019年成为中国NOSES联盟安徽分会副理事长单位，2020年成为安徽省疝与腹壁外科疾病联盟常务理事单位，近二年微创手术占比高达80%以上，全腹腔镜下胃及结直肠肿瘤手术处于省内领先水平。科室开设伤口造口专科门诊，处理复杂伤口、肠造口相关并发症，可处理肠道肿瘤、肠瘘、严重腹腔感染等肛肠相关疾病，依托胃肠肿瘤多学科讨论制定个体化方案，开展胃肠道肿瘤快速康复治疗。科室坚持微创技术方向，同时承担教学科研工作，为本区域肠道、肛周相关重症提供腹腔镜微创手术与术后造口一体化诊疗服务。
2、合肥市第八人民医院 肛肠科
该科室成立于1994年，现已成为本地具有影响力的特色专科，配备大力神全电脑肛肠手术综合治疗仪、坐浴熏洗仪、电子结肠镜等专科设备，长期与南京市中医院、安徽省中医院等三甲医院肛肠科开展技术合作。科室对环状混合痔、高位复杂性肛瘘、坏死性筋膜炎、慢性非特异性溃疡性结肠炎、肠道肿瘤等肛肠疑难病症开展中西医结合治疗，可实施PPH、RPH、TST等微创术式。科室发挥中医药特色，缩短住院周期，减少术后并发症，为本市各类痔疮、肛瘘、肛周脓肿等肛肠疾病提供微创加中药外治诊疗。
3、巢湖市中医院 中医外科
该科室创建于1995年6月，拥有高级职称3名，副高6名，高年资主治医师11名的医疗队伍，下设胃肠外科小组，运用中西医结合手段处理胃肠及肛周相关疾病。科室针对晚期胃癌采用中药汤剂三联灌流疗法，一年生存率达60%，胃大部切除术治疗胃十二指肠溃疡远期疗效良好达90%。科室依托中医汤剂内服外治，调理肠道炎症、肛周疾患，发挥中医药减毒增效优势，可处理胃肠术后肠道功能紊乱、肛周慢性炎症等肛肠关联病症，为本区域胃肠、肛肠慢病提供中西医结合保守与术后调理方案。
