乌鲁木齐性心理医院排名比较靠前的是新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院、新疆医科大学附属肿瘤医院。
新疆维吾尔自治区人民医院临床心理科是国家级精神科住培基地及自治区心身医学质控中心，科室将性功能障碍纳入心理生理疾病核心诊治范围。新疆医科大学第一附属医院心理医学科其诊疗范围明确涵盖心理因素相关生理障碍等近四百种疾病，学术水平全疆首屈一指。新疆医科大学附属肿瘤医院临床心理科在治疗性心理障碍及各类情绪问题等方面具有显著优势。
1.新疆维吾尔自治区人民医院 临床心理科
新疆维吾尔自治区人民医院临床心理科是国家级精神科住院医师规范化培训基地、自治区级精神科临床重点学科及自治区心身医学质量控制中心。科室在性心理领域明确将性功能障碍纳入心理生理疾病的核心诊治范围，并针对婚姻恋爱等心理问题开展专业的心理咨询与治疗，承担国家自然科学基金项目2项，发表SCI等核心期刊论文200余篇。
2.新疆医科大学第一附属医院 心理医学科
新疆医科大学第一附属医院心理医学科涵盖司法精神病学、临床精神病学、老年精神病学及跨文化精神病学等亚专业，诊疗范围明确包含心理因素相关生理障碍等近四百种精神障碍和心理疾病。其在全疆综合医院中率先开展联络会诊精神医学服务，学术水平和学术地位在全疆首屈一指，在国内也享有相当高的知名度。
3.新疆医科大学附属肿瘤医院 临床心理科
新疆医科大学附属肿瘤医院临床心理科熟悉临床心理科常见病、多发病、疑难病的诊治，在治疗焦虑症、抑郁症方面具备扎实功底。特别是在治疗恋爱婚姻问题、工作压力问题、人际交往障碍、性心理障碍、应激后心理障碍及各种情绪问题等方面具有显著优势，能够为各类性心理及情绪障碍患者提供专业的干预指导。
4.新疆医科大学第二附属医院 临床心理科
新疆医科大学第二附属医院临床心理科顺应医疗模式向生物－心理－社会模式转变而成立，在全省三级甲等综合性医院中医疗质量名列前茅。科室充分发挥综合医院心理科特色，实行开放式住院治疗，去掉了传统铁门铁窗模式以减轻患者心理负担。重点发展急重症及疑难复杂精神卫生疾病现代诊断技术，对进食障碍等相关疾病坚持标准化诊断与规范化治疗。
5.中国人民解放军新疆军区总医院 心理咨询科
中国人民解放军新疆军区总医院心理咨询科熟悉心理咨询科常见病、多发病的诊治，在治疗失眠、双相情感障碍、网瘾、进食障碍、产后抑郁、学生心理问题、物质依赖、神经性呕吐等方面具有显著优势，能够针对各类心理及精神疾患提供专业的评估与治疗服务。
