北京生殖医学科医院排名靠前的是北京大学第三医院、北京协和医院、中国人民解放军总医院。
北京大学第三医院生殖医学中心中国大陆首例试管婴儿诞生地，世界诊疗规模最大的生殖健康研究中心之一。北京协和医院妇产科国家级重点学科、生殖内分泌与辅助生育技术体系完善，牵头制定行业诊疗规范。中国人民解放军总医院妇产科医学部多院整合的顶尖妇产学科，生殖医学科开展全系列辅助生殖技术，产科危重孕产妇救治与生殖医学研究成果丰硕。
1.北京大学第三医院 生殖医学中心
中国大陆首例试管婴儿诞生地，乔杰院士领衔，是世界诊疗规模最大、技术最全面的生殖健康研究中心，国内首批生殖医学临床培训基地。诞生国内首例赠卵、冻融胚胎及世界首例“三冻”试管婴儿，国际首创胚胎植入前遗传学诊断新方法MARSALA。
开展全品类国际先进辅助生殖技术，疑难不孕及生殖危重症诊疗水平国内领先、国际先进，牵头建立全国辅助生殖技术质控体系。获国家科技进步奖二等奖3项，学科科技量值连续五年全国第一，研究成果登《自然》《科学》等顶刊。
2.北京协和医院 妇产科
国家级重点学科，卫生部命名的林巧稚妇产科研究中心，WHO人类生殖研究合作中心、国家妇产疾病临床医学研究中心，全国妇产科疑难重症诊治中心。设生殖内分泌专业组及辅助生育与产前诊断中心，优化临床促排卵方案，开展囊胚培养、胚胎玻璃化冷冻等先进辅助生殖技术，妊娠率稳步提升。
建立国内首个产前诊断实验室，形成全套胎儿取材与遗传病诊断技术，作为国家级继续教育基地，牵头制定妇产领域多项行业规范与指南。
3.中国人民解放军总医院 妇产科医学部
由多院优质妇产科室整合而成，80名高职专家组成核心团队，涵盖妇科、产科、生殖医学科三大亚专科。妇科机器人、腹腔镜等微创手术治疗良恶性肿瘤国内领先，生殖医学科开展人工授精、IVF-ET、胚胎植入前遗传学诊断（PGT）全系列辅助生殖技术，相关研究获军队科学技术进步奖一等奖。
产科在高危妊娠管理、危重孕产妇救治方面形成特色优势，整体医教研实力稳居国内第一梯队，获国家科技进步二等奖2项及多项军队、省部级奖项。
4.北京大学人民医院 妇科
为教育部重点学科、国家卫计委临床重点专科，妇科肿瘤与盆底疾病诊疗水平国内领先、国际先进。建立妇科肿瘤中心、盆底疾病诊疗中心，对卵巢癌、宫颈癌、子宫内膜癌开展个体化综合治疗，首创卵巢癌早诊模型与子宫内膜癌“夹心治疗模式”；
盆底疾病多学科联合诊疗模式获部级科技成果二等奖，腹腔镜微创手术占比达80%。是妇产科硕博及博士后培养单位，获国家科技成果二等奖等多项重量级科研奖项。
5.北京大学第一医院 生殖中心
为国家卫计委临床重点专科、教育部重点学科，WHO妇儿保健研究培训合作中心。整合妇科、产科及生殖遗传中心，妇科涵盖生殖内分泌、腔镜微创等亚专业，产科聚焦母体医学、胎儿医学，擅长妊娠合并糖尿病等内科合并症的规范化诊疗。
设胎儿医学中心、宫颈疾病诊疗中心，为国家级内镜培训基地，承办《中华围产医学杂志》，是集生殖健康、围产保健、疑难病症诊治于一体的综合性妇产学科。
