厦门中医科医院排名比较靠前的是厦门大学附属第一医院、厦门大学附属中山医院、厦门医学院附属第二医院。
厦门大学附属第一医院中医科依托国家级名老中医工作室，中西医结合诊疗实力突出，为省级重点专科。厦门大学附属中山医院中医科拥有多项省市级专科建设资质，老年病中西医结合诊疗为特色优势。厦门医学院附属第二医院中医科兼顾内科与妇科诊疗，同时承担多地中医药教学工作。
1、厦门大学附属第一医院 中医科
厦门大学附属第一医院中医科为省级临床重点专科，拥有国家级、省级名老中医工作室，也是福建省首批全国中医师范基地。科室依托综合医院资源，融合传统中医与现代医学，擅长消化道疾病、风湿骨病、老年慢病、糖尿病并发症及肿瘤的中西医结合调理。全面开展艾灸、穴位贴敷、中药熏蒸等各类中医外治适宜技术，教学与科研体系完善，承担多项国家级、省级科研项目，斩获医学科技奖项，学术研究成果丰富。
2、厦门大学附属中山医院 中医科
厦门大学附属中山医院中医科集医疗、教学、科研于一体，获评全国综合医院中医药工作示范单位。科室获批省级中医重点专科与市级中西医协同旗舰科室建设项目，以中药内服、特色康复、中西医结合为发展方向，诊治各类常见慢性病与疑难杂症。科室人员多人担任省级以上学会职务，主持多项国家级及省级科研课题，多篇研究论文收录于核心期刊与SCI，综合诊疗与学术教研能力扎实稳固。
3、厦门医学院附属第二医院 中医科
厦门医学院附属第二医院中医科开设中医内科、中医妇科专科门诊，对各类内科慢性病、疑难杂症及妇科疾病、不孕不育病症具备成熟的诊疗经验。科室立足中医药传统诊疗方式，辨证施治，诊疗规范完善。作为直属教学科室，长期承担厦门及周边多地院校中医专业临床教学与实习带教任务，持续输出中医药专业人才，以严谨的诊疗模式与优质的医疗服务，满足区域群众基础中医诊疗需求。
4、厦门中医院 中医内科
厦门中医院中医内科诊疗经验深厚，专业覆盖范围广泛。擅长呼吸道、心血管、肾脏、内分泌等多系统内科疾病的中医辨证治疗，针对慢性咳喘、高血压、糖尿病、各类感染性疾病等常见病、多发病及疑难病症，形成系统化中医诊疗方案。依托中医院平台，坚守纯中医诊疗特色，治法多样，配伍严谨，凭借稳定的临床疗效，为广大患者提供规范化的中医内科调理与治疗服务。
5、中国人民解放军第一七四医院 中医科
中国人民解放军第一七四医院中医科整合中药、针灸、推拿、现代康复技术为一体，诊疗项目齐全。擅长调理失眠、中风后遗症、肥胖、面瘫等内科问题，对颈腰椎病变、骨关节劳损等疼痛类疾病，以及皮肤、妇科、呼吸类常见急性病症疗效显著。科室配备全套先进康复理疗设备，拥有多项军队及市级科技成果奖项，人才梯队完善，兼顾军民医疗保障，在中医康复、疼痛治疗与特色外治疗法方面具备区域竞争优势。
