复旦大学附属华山医院北院擅长的科室有神经外科、皮肤科、肿瘤科、心内科等。
1、神经外科
复旦大学附属华山医院北院神经外科是国家教育部重点学科。学科发展方向：微侵袭神经外科（包括显微神经外科、颅底外科、内镜神经外科、神经导航、锁孔外科和血管内介入等）、分子神经外科、功能神经外科和立体定向放射外科等，涵盖神经外科的所有领域。主要分为下列亚专科：脑血管病、颅脑外伤、垂体瘤及鞍区病变、颅底外科、脑胶质瘤、小儿神经外科、脊柱脊髓外科、功能神经外科、神经肿瘤、神经放射、分子遗传等。
2、皮肤科
复旦大学附属华山医院北院皮肤科是国家教育部重点学科。在普通门诊之外还开设十余种专病门诊，包括性传播疾病、结缔组织病、遗传性皮肤病、化妆品皮炎、银屑病、白癜风、光感性皮肤病、特应性皮炎、真菌病、脱发等。治疗方面，设有激光治疗中心、皮肤科治疗室、光疗室、健疗室、皮肤外科手术室、白癜风治疗室、白癜风表皮移植中心、植发中心等多个治疗科室，治疗方法齐全。
3、肿瘤科
复旦大学附属华山医院北院肿瘤科是国家教育部重点学科。常规开展下列多种实体肿瘤的诊断、化疗、生物靶向治疗及肿瘤微创治疗，取得良好的诊疗效果：脑转移瘤、肺癌、乳腺癌、脑胶质瘤、胃癌、肠癌、食管癌、淋巴瘤、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、膀胱癌、软组织肿瘤、恶性黑色素瘤、卵巢癌等。科室特色：恶性肿瘤脑转移的诊治、原发灶不明恶性肿瘤的诊治、血管介入治疗、肿瘤消融治疗、静脉输液港（化疗泵，PORT）植入术等。
4、心内科
复旦大学附属华山医院北院心内科是集医疗、教学、科研于一体的临床科室，也是国家教育部重点学科。对主干病变、分叉病变、慢性完全闭塞病变等高难度的病变的介入治疗积累了丰富的经验。并在普通起搏器植入的基础上，开展了自动心脏复律除颤器（ICD）、双心室同步起搏治疗心力衰竭（CRT）植入等工作。电生理检查、射频消融术也有了长足的发展，擅长于室上性心动过速、频发室性早搏的射频消融手术，并成为国内少数能够进行三维标测系统(CARTO)引导下心房颤动消融术的中心之一。