恩施三甲医院有恩施土家族苗族自治州中心医院、湖北民族学院附属民大医院、建始县中医医院等。恩施土家族苗族自治州中心医院综合实力在全国30个少数民族自治州中榜首；湖北民族学院附属民大医院拥有11个省级临床重点专科，是全国综合医院中医药工作示范单位；建始县中医医院是湖北省示范中医院，拥有脾胃科等5个省级重点专科。
第一名：恩施土家族苗族自治州中心医院
恩施土家族苗族自治州中心医院是恩施州及周边地区第一所集医疗、科研、教学和保健于一体的三甲医院，是省级文明单位，湖北省“五·一”劳动奖状获得单位，湖北省三级优秀医院。2017年，医院综合实力位居全省医疗机构第一方阵，跻身“中国医院竞争力排行榜”全国地市级医院百强，在全国30个少数民族自治州中榜首。
第二名：湖北民族学院附属民大医院
湖北民族学院附属民大医院是武陵山地区一所集医疗、教学、科研、急救、防保、康复、培训为一体的高校直属附属医院、国家三级甲等综合医院，拥有11个省级临床重点专科，并且十三五”以来承担国家级、省部级科研课题数十项，并有多项科研项目获省、州科技进步奖。荣获“全国综合医院中医药工作示范单位”、“湖北省五一劳动奖状”等荣誉称号。
第三名：建始县中医医院
建始县中医医院是湖北省文明单位，湖北省示范中医院、省级卫生先进集体，拥有覆盖全院的从医疗、服务到管理的集成医院信息网络系统，拥有脾胃科、妇科、呼吸内科、内分泌科、骨伤科5个省级重点专科；针灸科、脑病科、心血管科、眼科、儿科、肛肠科6个州级重点专科，开展新业务、新技术50余项，重点专科集群已具规模，区域影响力进一步扩大，综合服务能力进一步提升。
第四名：利川市民族中医院
利川市民族中医院逐步发展成为一所集医教研于一体、中医特色突出的国家三级甲等中医医院，同时凭借科学规范的管理、富有特色的中医专科、先进的诊疗设备、高效优质的服务，实现了稳步快速发展，各项指标在湖北省同级中医院名列前茅，在恩施州同级中医院名列榜首。
第五名：利川市人民医院
利川市人民医院，已发展成为一所集医疗、急救、康复、预防、保健、教学、科研为一体的三级综合医院。拥有22个省级临床重点专科、33个州级临床重点专科，专科创建成果位居全州同级医院之首、全省同级医院前列；成功创建为中国胸痛中心、国家防治卒中中心。医院在2018年度湖北省153家县级医院综合实力考评中位居第一名，在67家三级医院综合实力考评中位居26名。
第六名：恩施市中心医院
恩施市中心医院，是恩施市人民政府举办的唯一一家集医疗、保健、教学、科研于一体的公立三级综合医院，是恩施市急救中心和州、市职工医保、城乡居民医保定点医院，为武汉大学人民医院（湖北省人民医院）恩施医院，华中科技大学同济医学院附属同济医院技术协作医院、附属协和医院对口支援医院，武汉大学中南医院技术协作单位等。
第七名：恩施华龙总医院
恩施华龙总医院，是集医疗、教学、预防、保健和医养结合于一体的最大的社会办医疗机构，是经恩施自治州人民政府同意、湖北省卫生和健康委员会批准建设的三级综合性医院，是省、州、市（县）三级基本医疗保险定点医院和州内30余家保险公司的商业保险定点医院。医院现已开设心血管病中心、神经疾病诊疗中心、肾脏病中心、消化疾病及内镜诊疗中心，普外科、肝胆胰胃肠微创外科及肝胆胰结石病中心等16个临床科室和6个医技科室。