菏泽胸外科医院排名靠前的是菏泽市立医院胸外科、菏泽医专附属医院心胸外科、菏泽市牡丹人民医院胸外科等，菏泽市立医院胸外科是菏泽市医学会胸外科学会主委单位、菏泽医学重点学科，2023年被授予国家癌症中心/中国医学科学院肿瘤医院胸外科专科医联体；菏泽医专附属医院心胸外科是医院重点发展科室，对早期肺部小结节诊治达到省内先进水平，各类胸腔镜微创手术占科室总手术量的50%；菏泽市牡丹人民医院胸外科是牡丹区医疗、教学、科研中心及学术带头单位，食管-胃吻合口瘘及支气管残端瘘的发病率降至1%以下。
1、菏泽市立医院 胸外科
该科室前身为1997年成立的心胸外科，2014年独立建科，是菏泽市医学会胸外科学会主委单位、菏泽医学重点学科，2023年被授予国家癌症中心/中国医学科学院肿瘤医院胸外科专科医联体，为山东省胸外科肺段联盟菏泽区域分中心。诊疗方面可开展纤维支气管镜诊疗、肺活检及肺泡灌洗，胸腔镜下全系列肺、纵隔、食管良恶性疾病微创手术，以及剑突下切口胸腔镜辅助纵隔肿瘤切除术等。下设肺结节微创治疗、手汗症、食管功能外科三大特色门诊，其中肺结节采用射频/冷冻消融联合胸腔镜微创手术的杂交术式，可一次麻醉解决多肺叶、多部位结节问题，最大程度保留患者肺功能。科研方面，2023年获科研立项1项并通过鉴定1项，2024年立项1项。
2、菏泽医专附属医院 心胸外科
该科室是医院重点发展科室，对早期肺部小结节诊治达到省内先进水平，在肺部小结节、毛玻璃样结节、微小结节的早期筛查、鉴别诊断、合理随访和及时外科治疗方面经验丰富。各类胸腔镜微创手术全面熟练开展，占科室总手术量的50%，涵盖全胸腔镜下肺癌根治术、肺叶切除术、肺段切除术、纵隔肿瘤切除术、气胸肺大泡切除术、手汗症胸交感链切断术等，可开展单孔、单操作孔、三孔、四孔等各类胸腔镜微创术式。科室还常规开展袖状切除、支气管+血管双袖状切除成形、扩大袖状切除、胸膜顶肿瘤切除、三切口食道癌淋巴结二野和三野清扫等复杂手术，配备德国STORZ腹腔镜系统、爱尔博电外科工作站等先进设备支撑诊疗精准开展。
3、菏泽市牡丹人民医院 胸外科
该科室是医院重点科室，也是牡丹区医疗、教学、科研中心及学术带头单位，自上世纪五十年代即开展下段食管癌诊疗，技术积累深厚。诊疗覆盖胸部损伤、肺及胸膜疾病、胸壁疾病、食管及贲门疾病、纵隔疾病五大类胸外科疾病，1996年成功开展颈、胸、腹三切口食管癌切除术，2000年开展胸部小切口食管癌根治术、肺癌根治术，近年又开展心包内肺癌切除术、袖式支气管肺叶切除术等新技术。吻合器、缝合器广泛应用于相关手术中，食管-胃吻合口瘘及支气管残端瘘的发病率降至1%以下。科研方面，已完成市级科研项目6项，均获菏泽市科技进步奖，发表省级以上论文30余篇，承担菏泽医专等院校临床教学及乡镇医院进修培养任务。
4、单县中心医院 胸心外科
该科室始建于20世纪80年代，1987年正式成立，可开展普胸外科及心脏外科两大领域的诊疗项目。普胸外科方面，常规开展食管癌、贲门癌、肺癌手术及纵隔肿瘤切除术等，可成熟应用电视胸腔镜技术开展肺大疱切除、肺叶楔形切除、纵隔肿瘤切除、恶性胸腔积液诊治、肺叶切除术、辅助小切口肺癌手术等，能开展多孔、多操作孔、单操作孔等多种胸腔镜微创术式，还可开展微创Nuss钢板漏斗胸畸形矫治术。心脏外科方面，可开展先天性心脏病、后天性瓣膜病、胸主动脉瘤、心脏肿瘤等多种心脏大血管疾病的外科治疗，涵盖先心病矫治、瓣膜置换及成形等术式。
5、曹县人民医院 胸外科
该科室熟悉胸外科常见病、多发病、疑难病的诊治，诊疗优势覆盖胸壁疾病、肺部胸膜疾病、食管疾病、纵隔疾病等多个领域，其中胸壁疾病包含肋软骨炎、肋骨骨折、肋间神经痛等，肺部胸膜疾病包含气胸、血胸等，食管疾病包含食管先天性疾病、食管裂孔疝、食管癌等，纵隔疾病包含胸腺瘤、重症肌无力等，在上述疾病的治疗方面具有显著优势。
