深圳神经内科医院排名比较靠前的有深圳市人民医院、深圳市第三人民医院、北京大学深圳医院等，深圳市人民医院神经内科是深圳市重点学科及深圳市优势重点学科群；深圳市第三人民医院神经内科，是卒中中心核心科室；北京大学深圳医院神经内科是院级重点专科。
第一名：深圳市人民医院-神经内科
深圳市人民医院神经内科，是深圳地区历史最悠久、技术力量最雄厚的神经科团队，一直是深圳地区神经内科专业的领头羊，集临床、科研、教学为一体，是深圳地区培养神经科博士、硕士最多的研究生培养基地。2011年被评为深圳市重点学科及深圳市优势重点学科群，2015年被评为中国卒中联盟中心深圳分中心。2015年被评为深圳市医管中心品牌科室。2016年获中国卒中联盟卒中先锋奖，同年获国家卫计委脑防办高级卒中中心。
第二名：深圳市第三人民医院-神经内科
深圳市第三人民医院神经内科，是卒中中心核心科室，国家老年疾病临床医学研究中心协同创新网络成员单位，深圳市卒中临床研究网络成员单位，深圳市急性脑卒中医疗救治定点单位，中国医师协会神经内科医师分会、深圳市医师协会神经内科医师分会中枢神经系统感染与免疫学组成员单位，神经内科缺血性脑血管病介入专科联盟单位，南方科技大学第二附属医院住院医师规范化培训基地神经内科教研室。
第三名：北京大学深圳医院-神经内科
北京大学深圳医院神经内科是院级重点专科，诊疗范围包括头痛富、眩晕、癫痫、睡眠障碍、脊髓病变、中枢神经系统脱髓鞘疾病、中枢神经系统感染、帕金森病以及各类脑血管病。对神经系统疑难、危重病人的诊治积累了较丰丰富的临床经验。
第四名：深圳市第二人民医院-神经内科
深圳市第二人民医院神经内科分综合病区、脑血管病病区，现已建成可收治脑血管病、癫痫、各类脑炎、帕金森、认知、头痛头晕、睡眠障碍、格林巴林、重症肌无力、多发性硬化等所有神经系统疾病的院级重点学科。主要承担深圳地区神经系统的常见病、多发病和疑难病的诊治工作。
第五名：中山大学附属第八医院-神经内科
中山大学附属第八医院神经内科主要以急性脑血管病诊疗为中心，开展急性脑梗死动、静脉溶栓、机械取栓及球囊支架血管成形术，为卒中病人提供最新的科学治疗和管理模式，取得很好疗效。重点专业方向为脑血管病、眩晕、帕金森及运动障碍疾病。
第六名：中山大学附属第七医院-神经医学中心
中山大学附属第七医院神经医学中心是医院重点建设学科，集医疗、教学、科研为一体，实行神经医学中心框架下的神经内、外科一体化管理。学科以癫痫中心、脑血管病中心为发展重点，突出建设睡眠诊疗、神经血管超声两大特色平台，覆盖神经重症等全部神经系谱疾病亚专科。其中神经内科下设帕金森病和痴呆症等神经变性病、感染与神经免疫疾病、神经遗传病、神经肌肉病、神经心理等亚专业；神经外科下设颅脑肿瘤、脑血管病、颅脑外伤、脊柱脊髓、功能神外、内镜颅底外科等亚专业。
第七名：香港大学深圳医院-神经内科
香港大学深圳医院神经内科，属于内科的一个亚专科，擅长急性脑血管病、帕金森病及运动障碍疾病、中枢神经炎症及免疫性疾病、周围神经及肌肉疾病、癫痫等的诊治。同时，神经内科已开展肌电图、神经传导速度测定、诱发电位、脑电图、经颅多普勒等检查，可为临床诊治提供重要参考。
第八名：深圳市罗湖区人民医院-神经内科
深圳市罗湖区人民医院神经内科是深圳市急性脑卒中医疗救治定点医院之一。开展急性脑梗塞静脉和动脉溶栓治疗，取得良好疗效。开展颅外动脉狭窄支架置入治疗颅外动脉狭窄。开展大剂量甲强龙冲击治疗视神经脊髓炎、播散性脑脊髓炎、重症肌无力危象等神经免疫性疾病。开展大剂量丙种球蛋白冲击治疗吉兰巴雷综合征和重症肌无力危象等。以朱治山主任带领的神经内科建立了急性脑梗塞溶栓治疗团队，能够常规开展急性脑梗塞静脉和动脉溶栓治疗。