甲状腺癌建议就诊于普通外科，南京地区治疗甲状腺癌排名靠前的医院是南京医科大学第一附属医院普通外科、南京鼓楼医院普通外科、东南大学附属中大医院普通外科。南京医科大学第一附属医院普通外科为国家临床重点专科，甲状腺诊疗综合实力强劲；南京鼓楼医院普通外科是国家重点学科，甲乳外科技术规范成熟；东南大学附属中大医院普通外科为江苏省临床重点专科，甲状腺微创诊疗特色鲜明。
1、南京医科大学第一附属医院 普通外科
该科室是国家临床重点专科、江苏省政府重点学科，为临床医学博士学位授权点及博士后流动站。设甲状腺外科亚专业，拥有中国工程院院士领衔的顶尖团队，获国家、省部级科技奖60余项，承担多项国家级课题。开展MDT多学科协作模式，参与制定行业诊疗规范，甲状腺癌根治及综合治疗水平国内先进，国际学术影响力突出。
2、南京鼓楼医院 普通外科
该科室首批国家临床重点专科，设甲乳外科亚专科，为多所高校博硕士学位授予点及博士后流动站。学科带头人丁义涛教授为国内知名肝胆外科专家，科室获多项国家、省级科技进步奖，擅长甲状腺、甲状旁腺规范化手术及腔镜辅助微创手术，诊疗技术与疗效处于省内领先、国内先进水平。
3、东南大学附属中大医院 普通外科
该科室是江苏省临床重点专科、东南大学微创外科研究所依托单位。甲状腺疾病诊疗覆盖多个病区，由李俊生教授等骨干领衔，擅长甲状腺肿瘤微创术式，兼具疗效与美观，并发症少。获国家、省部级科技进步奖10项，与多国医院建立协作关系，微创诊疗技术在华东地区声誉卓著。
4、南京市第一医院 普外科
该科室为甲乳专业为核心特色之一。配备高端诊疗设备，每年收治甲状腺癌600余例，擅长改良甲状腺癌根治术、综合治疗及早中期乳腺癌保乳手术。获南京市医学科技重点项目资助，发表多篇国内外核心论文，快速康复理念应用成熟，诊疗规范且疗效稳定。
5、南京市第二医院 外科
该科室历史悠久，依托三级甲等医院综合实力，集医教研防于一体。拥有多名省级人才及高校博硕导师，外科诊疗功底扎实，可规范开展甲状腺良恶性肿瘤的诊断、手术及术后康复治疗。依托医院肿瘤诊疗特色，能为甲状腺癌患者提供个性化诊疗方案，兼顾综合治疗与长期随访管理。
