厦门儿科医院排名靠前的是厦门大学附属第一医院儿科、厦门大学附属中山医院儿科、厦门市妇幼保健院儿科等，厦门大学附属第一医院儿科是福建省综合性医院中专业最齐全的儿童医疗救治中心，拥有卫生部儿科重症国家临床重点专科等多项国家级、省市级专科资质；厦门大学附属中山医院儿科对儿童疑难病及危重症的诊治具有成熟的临床综合实力，每年承接福建各地大量疑难重症患儿的转诊与会诊；厦门市妇幼保健院儿科是闽西南妇幼保健儿科中心，儿童肾脏亚专业诊疗技术处于省内领先水平。
1、厦门大学附属第一医院 儿科
该科室成立于1971年，是福建省综合性医院中专业最齐全的儿童医疗救治中心，涵盖新生儿、呼吸、重症等12个亚专科，长期承担厦门及周边地区大量儿童的救治任务，近年来年门急诊量达45万余人次，年收住院8500人次以上。该科室是卫生部儿科重症国家临床重点专科、福建省儿科重点专科，拥有国家儿科临床药物试验基地、国家儿科专科医师培训基地等国家级平台，也是国家呼吸系统疾病临床医学研究中心福建省分中心（全省唯一）。科研领域，设有厦门市儿科重点实验室、儿科转化医学实验室等科研平台，近3年获授权专利4项、软件著作权6项，参与制定诊疗指南或专家共识25项，发表SCI收录论文17篇、中华系列杂志学术文章33篇，获省（部）级及市级二等以上科技奖项5项。
2、厦门大学附属中山医院 儿科
该科室创建于1988年，致力于儿童内科疾病的诊治，对儿童各系统疾病形成了规范、合理的诊疗模式，覆盖小儿呼吸、消化、神经、内分泌等多个亚专科，年门急诊量10余万人次，年出院5000余人次。该科室对儿童疑难病及危重症的诊治具有成熟的临床综合实力，每年接受来自福建各地的大量疑难重症病患者，承接周边地区医院的疑难危重病人转诊和会诊。该科室是国家儿科住院医师规范化培训基地、厦门大学小儿内科研究生培养基地，也是中华医学会儿科学分会全国儿童毛细支气管炎协作组委员单位、国家二级癫痫中心单位，同时承担多所医学院校的临床医学、护理专业理论教学及临床见习、实习教学工作，接收社区及周边地区学员进修。
3、厦门市妇幼保健院 儿科
该科室以儿童肾脏泌尿系统疾病、先天遗传代谢疾病、风湿免疫性疾病等为重点发展方向，年诊治门诊患者15万余人次，年住院患者近5000人次，外地患者占比超1/5，是美国儿科协会教学基地、福建省儿童遗尿专家协作组诊治定点医院，也是闽西南妇幼保健儿科中心，在省内具有较大影响力。该科室儿童肾脏亚专业是厦门市最早建立的儿童肾脏疾病专业，也是福建省儿童肾脏泌尿疾病诊治技术最先进的专科之一，1999年完成福建省儿科首例儿童难治性肾病肾穿刺病理活检术，可接受肾穿刺患儿最小年龄为1岁，年收治复杂性尿路感染患儿250例左右；呼吸亚专业拥有全省最大的门诊雾化治疗中心，标准化建设水平处于国内领先。科研方面，近年承担省级青年课题1项、市级科研项目6项，近5年获专利1项、出版著作1部、发表论文60余篇。
4、复旦大学附属儿科医院厦门分院 儿内科
该科室成立于2014年，依托连续多年位居复旦版中国医院专科声誉排行榜儿科首位的复旦大学附属儿科医院资源支撑，实行技术与管理平移模式，由复旦大学附属儿科医院专家长期坐诊指导，核心护理人员均赴复旦大学附属儿科医院门急诊进修学习，并有复旦儿科护理专家现场开展技术指导与管理。该科室开设普通门诊、专科门诊、专家门诊，专业范围覆盖新生儿、呼吸、消化、感染、神经等多个亚专科，设有抢救室、监护室等功能区域，配有小儿呼吸机、气管插管全套设备等先进抢救设备，实行全年无假日门诊，目前主要收治儿内科呼吸道和消化道疾病患儿，后续将进一步扩容，覆盖更多专科疾病诊治需求。
5、厦门医学院附属第二医院 儿科
该科室配备蓝光箱、高端暖箱、新生儿辐射式抢救台、呼吸机、多参数监护仪、除颤仪等各类儿童诊疗及急救抢救设备，可满足儿童常见疾病及急危重症的救治需求。作为厦门医学院直属教学医院的临床科室，该科室长期承担厦门医学院儿科学相关的临床教学和实习带教任务，同步推进医疗服务、教学实践与科研探索工作，科室医务人员形成了严谨求实、勤勉敬业、规范细致的工作作风与团结协作的工作氛围，全力为广大患儿提供优质、规范的医疗技术服务。
