聊城市人民医院擅长儿科、肛肠科、泌尿外科、骨外科、感染性疾病科，这些科室均是省级重点专科，学科特色鲜明，优势明显，可为患者提供高水平、高质量的诊疗服务。
1、儿科
是国家中医药管理局“十二五”重点学科，是山东省医药卫生重点专业、山东省临床重点专科，承担鲁西及周边地区儿童医疗、保健、科研及教学任务。科室成立了远程会诊中心，实现了疑难危重病例远程会诊，使当地患儿在家门口就可享受全国顶尖水平的医疗服务。
2、肛肠科
是国家“十二五”重点专科建设单位和山东省中医药重点学科，集医、教、研为一体。现已发展成为中医、中西医结合标准化、规范化治疗肛肠疾病的特色优势科室。临床对肛肠科疑难疾病的诊治，积累了丰富的临床经验，在省内及周边地区享有极高的声誉。
3、泌尿外科
是山东省临床重点专科，在全国地市级医院泌尿外科排名第7，学科规模在聊城市处于领先地位。科室引进目前全世界最先进第四代达芬奇机器人，在院内率先开展了机器人辅助肾部分切除术。并开展复杂的体外循环下肾癌根治性切除+右心房、下腔静脉癌栓取栓术，达国内领先水平。
4、骨外科
为省重点学科，是聊城市技术力量最强、设备最先进和规模最大的骨科诊疗中心。下设创伤外科、脊柱外科、关节外科等亚专业，各专业独立开展工作，专业主任技术水平均在省内领先，可为患者提供优质的诊疗服务。
5、感染性疾病科
是鲁西及晋冀鲁豫周边地区肝病及感染性疾病临床、教学、科研及疑难危重病人抢救、诊治中心。同时也是国家级规培教学基地、国家药物临床实验基地。科室在省内率先建立感染重症监护室，拥有人工肝支持治疗设备、肝脏穿刺枪等设备，为危重患者的抢救工作提供了保障。
