重庆神经科医院比较好的是陆军军医大学第一附属医院、重庆医科大学附属第一医院、陆军军医大学新桥医院，陆军军医大学第一附属医院的神经内科，设有多个专病门诊，部分新技术居国内领先水平。重庆医科大学附属第一医院的神经内科是西部地区最早的神经病学博士学位授权点和博士后流动站；陆军军医大学新桥医院的神经内科设备先进、技术力量雄厚，在国内享有较高声誉。
第一名：陆军军医大学第一附属医院-神经内科
陆军军医大学第一附属医院的神经内科，是集神经及精神疾病诊治一体的综合学科，设有脑血管病介入诊疗、痴呆/脑病防治、神经肌肉疾病、癫痫、神经心理咨询、高压氧治疗等专病门诊。已开展的脑血管造影、介入治疗、动脉溶栓、静脉溶栓和肌张力障碍的肉毒毒素治疗等新技术居国内领先水平，已批准成立重庆市介入脑血管病研究所。
第二名：重庆医科大学附属第一医院-神经内科
重庆医科大学附属第一医院神经内科是西部地区最早的神经病学博士学位授权点和博士后流动站。2007年成为我国西部地区唯一的国家级神经病学重点学科。2010年底，医院被批准为卫生部“脑卒中筛查及防治基地”，同时科室是卫生部“十二五”脑卒中质量控制省级中心和重庆市神经疾病质量控制中心。2012年，获卫计委“国家临床重点专科”建设项目。科室现有开放床位208张。科室开展了血管内介入治疗、动静脉溶栓、无创脑水肿检测等特色医疗和技术，脑血管疾病、癫痫、帕金森病、头痛等亚专科建设及各项医疗指标位居国内前列。
第三名：陆军军医大学新桥医院-神经内科
陆军军医大学新桥医院的神经内科是重庆市脑血管病重点学科，是集医、教、研为一体，在国内享有较高声誉的临床专业学科，科室技术力量雄厚。中心设备先进、技术力量雄厚，介入诊疗例数和难度处于国内领先水平。重症神经疾病监护病房的硬件设施和综合救治能力均达到国内先进水平。临床神经电生理和组织病理检查室仪器设备和检测技术先进。
第四名：重庆大坪医院-神经内科
重庆大坪医院神经内科科研成果丰硕，人才队伍建设成绩突出，2011年荣立集体二等功。学科被批准为重庆市重点学科，卫生部脑卒中筛查与防治基地、卫生部脑血管病介入诊疗培训基地。学科孕育着巨大的可持续发展潜力，全科人员团结一致，正在为建成国际知名学科而努力拼搏。
第五名：重庆医科大学附属第二医院-神经内科
重庆医科大学附属第二医院的神经内科是国家重点学科、重庆市重点学科，可诊治神经科各种疾病，如急慢性脑血管病、癫痫、脑炎、脑膜炎、帕金森氏病、痴呆、多发性硬化、肌肉疾病、周围神经病、眩晕、头痛、失眠等。在脑血管疾病、癫痫、帕金森氏病、痴呆等疾病诊疗方面具有领先优势，在西南地区享有一定盛誉。
第六名：重庆市人民医院-神经内科
重庆市人民医院神经内科由两江院区神经内科和三院院区神经内科单元组成，是重庆市临床重点建设专科，是承担国家脑防委基地医院任务学科。发表论文160余篇，其中SCI文章67篇，总影响因子296.23分，主编专著4部。
第七名：重庆市公共卫生医疗救治中心-神经内科
重庆市公共卫生医疗救治中心的神经内科，对于神经内科的脑出血（包括蛛网膜下腔出血）、缺血性脑血管病（脑血栓形成，脑栓塞，TIA，烟雾病等）、各类型癫痫及颅内感染、面瘫（口眼歪斜）、头痛眩晕、脊髓病、多发性硬化、肌炎、各型肌无力（包括MG）、肌萎缩、肢体麻木等周围神经病、失眠及抑郁、帕金森综合征等锥体外系疾病、痴呆等神经系统变性疾病都有较高诊治水平。
第八名：中国人民解放军陆军第九五八医院-神经内科
中国人民解放军陆军第九五八医院神经内科以急性脑血管病发病机制研究及临床救治为特色，每年收治脑出血、脑梗塞、蛛网膜下腔出血、短暂性脑缺血发作患者300余人次。成功抢救了大量的重危患者，抢救成功率达90%以上。
第九名：重庆市第九人民医院-神经内科
重庆市第九人民医院神经内科，是重庆市神经病学重点专科和重庆市区域医学重点学科，中国卒中学会挂牌综合卒中中心及国家卒中远程会诊中心重庆分中心，重庆市规培基地及重庆市优质护理病房，是重庆北部地区卒中（脑血管）救治技术实力最强的专科，拥有一支技术力量强、服务质量优的医护团队。
第十名：重庆市南川区人民医院-神经内科
重庆市南川区人民医院的神经内科，是重庆市临床重点专科，重庆市区域医学重点学科。科室开展脑梗死了桥接机械取栓血管内治疗，降低了脑卒中患者致残率及死亡率。帕金森病科室开展帕金森病的早期诊断、个体化的治疗及伴有认知功能障碍的诊治，取得良好成果。睡眠障碍科室开展针对失眠等睡眠障碍问题进行系统化、科学化干预，对现代人紧张生活亚健康人群提供健康保障。