北京针灸科医院排名靠前的是首都医科大学附属北京中医医院、中国中医科学院广安门医院、北京中医药大学东直门医院。
首都医科大学附属北京中医医院针灸科国家临床重点专科、云脑血管病针灸诊疗技术全国推广，科研与技术辐射力行业顶尖。中国中医科学院广安门医院针灸科全国创建最早科研成果发表于国际顶级期刊，达国际顶尖水平。北京中医药大学东直门医院针灸科建院即设的医院重点科室，程莘农等针灸名家奠基，针灸治疗中风、面瘫等病种疗效显著。
1.中国中医科学院西苑医院 针灸科
为医院建院初期设立的核心科室，也是全国最早成立的针灸科之一，经黄竹斋等老一辈针灸名家深耕积淀，医教研全面发展。主持并参与科技部、北京市科委等多项国家级、省部级科研课题，获多项国家发明专利。开展毫针、火针等传统疗法及头针、腹针等微针疗法。
可治疗脑病、骨伤、内、妇、皮、五官等百余种常见多发病，开设面神经炎、失眠、过敏性鼻炎等多个专病门诊，针灸疗法疗效显著、适用范围广。
2.中国中医科学院广安门医院 针灸科
汇集朱琏、高凤桐等国家级针灸名家，是国家中医药管理局重点学科和重点专科，现已发展为针灸、神内、康复三位一体的大型专科。拥有八髎芒针深刺、核桃皮眼镜灸等特色技术，擅长诊治脑卒中、帕金森病、颈肩腰腿痛等疾病，对卵巢功能减退、不孕不育、肥胖等病症的针灸治疗为研究重点。
3.北京中医药大学东直门医院 针灸科
伴随建院成立的医院重点科室，由程莘农、杨甲三等著名针灸专家奠基，是国内首批涉外针灸医疗和学术交流单位。杨甲三取穴经验被全国推广，形成独具特色的中风病辨证论治方法，“针灸治疗周围性面瘫”为医院十大优势病种。拥有火针透刺、子午流注针法等特色疗法，擅长诊治中风、失眠、颈腰椎病、月经不调等疾病。
4.首都医科大学附属北京中医医院 针灸科
汇集金针王乐亭、国医大师贺普仁等针灸大家，是国家临床重点专科、中医药管理局重点学科，拥有针灸神经调控北京市重点实验室。创立贺氏针灸三通法并制定火针国家标准，建立脑血管病急性期绿色通道，开展从溶栓到康复的全程诊疗，“中风十三治”技术在全国推广。
