上海神经内科比较厉害的医院是复旦大学附属华山医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院、复旦大学附属中山医院。
复旦大学附属华山医院神经内科历史最久、综合实力最强，是国家重点学科与WHO合作中心。上海交通大学医学院附属瑞金医院神经内科由元勋级专家创立，科研与临床声誉卓著。复旦大学附属中山医院神经内科是国家临床重点专科，发展稳健。
1、复旦大学附属华山医院 神经内科
由张沅昌教授于1950年创立，是WHO神经科学研究和培训合作中心、教育部国家重点学科及卫生部临床重点专科。科室在四大方向享誉全国。董强教授领衔的脑血管病组是中国卒中学会副会长单位。吕传真、卢家红教授带领的神经免疫组在重症肌无力研究上居国内外领衔地位；洪震教授领衔的癫痫组是中国癫痫协会会长单位。
蒋雨平教授领衔的神经变性病组是帕金森病国家攻关项目牵头单位。年门诊量逾40万，是上海规模最大、亚专业最全的顶尖神经专科。
2、上海交通大学医学院附属瑞金医院 神经内科
学科由曾负责中央首长保健的著名专家徐德隆教授于1963年创立，现为国家临床重点专科、教育部国家重点（培育）学科，在复旦版专科排行榜中稳居全国前十。科室设有运动障碍、认知障碍、神经免疫等齐全的亚专业，科研实力雄厚，累计获得国家及省部级科技奖26项，主持多项“973”、“863”及国家自然科学基金重点课题。
学科带头人陈生弟、刘军教授均为领域内知名专家，在帕金森病、阿尔茨海默病等神经变性病诊疗与研究方面处于国内领先地位。
3、复旦大学附属中山医院 神经内科
科室历史可追溯至1950年国内首批成立的神经病学学科，现为国家临床重点专科、国家药理临床试验基地及复旦大学癫痫诊治中心之一。在汪昕教授等带领下，科室形成了脑血管病、癫痫与睡眠障碍、神经退行性疾病、神经肌肉疾病四个特色亚专科，并作为上海市首批神经内科住院医师规范化培训基地，承担重要的医疗、教学与科研任务
。依托中山医院强大的综合平台，科室在疑难重症诊治与临床新技术应用方面稳步提升，具有一定全国影响力。
4、上海交通大学医学院附属仁济医院 神经内科
由周孝达教授于1952年创建，被誉为上海乃至中国神经病学的发源地之一。科室规模庞大，开放床位超300张，是首批“国家综合癫痫中心”、“国家神经免疫与感染疾病研究分中心”及“上海市脑卒中临床救治中心”。亚专业设置极为齐全，并牵头开设功能性神经疾病、帕金森病、认知障碍等多个多学科诊疗（MDT）门诊。
作为多个国家级中心的挂靠单位，科室在脑血管病、神经免疫病、癫痫等重大神经系统疾病的临床诊疗与科研转化方面拥有强大实力和深厚积淀。
5、上海交通大学医学院附属第九人民医院 神经内科
科室是上海市第一批市级脑卒中中心及神经内科住院医师规范化培训基地，拥有黄浦、宝山、浦东三个院区。临床特色鲜明，尤其在脑血管病的神经介入治疗、帕金森病一站式诊疗、三叉神经痛微创球囊压迫术等方面形成显著优势。科研创新能力突出，近年承担9项国家自然科学基金项目，团队在Neurology、Stroke等国际权威期刊发表多篇论文。科室在卒中急救、神经变性病及眩晕等领域均衡发展，致力于为患者提供优质、精准的医疗服务。
