合肥胸外科比较好的医院是安徽省胸科医院、安徽医科大学第一附属医院、安徽省立医院，安徽省胸科医院胸外科在肺结核合并空洞大咯血等疾病的外科治疗处于省内领先水平。安徽医科大学第一附属医院的普胸外科与国际普胸外科先进技术接轨，安徽省立医院的胸外科被安徽省卫生厅评为安徽省临床重点学科。
第一名：安徽省胸科医院
安徽省胸科医院胸外科已广泛开展普胸外科各类良恶性疾病（肺、气管、纵隔、胸壁、食管、贲门等脏器疾患）的诊断和鉴别诊断、外科手术及围手术期抗肿瘤、抗结核等辅助治疗。尤其在肺部磨玻璃样小结节（GGO）、各类肺癌、纵隔肿瘤、食管癌以及结核性毁损肺、难治性肺结核、耐多药肺结核、肺结核合并空洞大咯血等疾病的外科治疗处于省内领先水平。
第二名：安徽医科大学第一附属医院-普胸外科
安徽医科大学第一附属医院的普胸外科是安徽省最早开展胸心外科手术的胸外专科。与国际普胸外科先进技术接轨，开展了大批的新技术、新业务，手术量逐年扩大，治疗效果越来越好，形成了独特的胸外科品牌。被评为安徽省卫计委临床重点专科。近年来，该科将微创手术作为发展方向，食管癌、肺癌、纵膈肿瘤切除等手术均已向微创术式过渡，微创手术已占总手术量的60%以上。
第三名：安徽省立医院-胸外科
安徽省立医院的胸外科被安徽省卫生厅评为安徽省临床重点学科，门诊量、手术量、出入院人次连续多年保持全省第一。2015年底在省内率先成立肺与纵隔外科、食管外科和胸部肿瘤外科三个亚专科。微创胸腔镜手术已成为特色核心技术，目前微创胸腔镜手术百分比占85%以上。是安徽省开展胸腔镜时间最早、手术病种覆盖最齐全、手术例数最多的科室，手术技术已达到省内龙头、国内先进水平。
第四名：安徽医科大学第二附属医院-心胸外科
安徽医科大学第二附属医院的心胸外科，成立了一只由国内一流专家组成的学术团队及由高、中、初级医务人员组成的临床队伍，师资队伍结构合理，学科综合技术力量在同级医院处于领先地位。该科室常规开展各种单纯和复杂性心脏畸形的手术矫治，手术成功率高，并发症少。同时积极开展成人先心病合并重度肺高压、双向分流病例的综合治疗。
第五名：合肥市第一人民医院-胸心外科
合肥市第一人民医院的胸心外科，目前临床业务、科教研水平均处于市级医院领先水平。拥有国际先进的人工呼吸机、人工心肺机、除颤仪、主动脉球囊反搏机和多种监护仪等高档医疗设备，硬件设施国内一流。年手术量400余台，常规开展以胸腔镜手术为代表的胸部微创手术，在同级别医院处于领先水平。
第六名：合肥市第二人民医院-胸心外科
合肥市第二人民医院的胸心外科是国家住院医师临床规范化培训基地，安徽医科大学硕士培养点。集医、教、研于一体，以微创及快速康复特色，成立肺部结节诊疗中心，2021年被评为安徽省首批快速康复（ERAS）区域示范病房，近年来开展达芬奇机器人（XI）手术，胸壁外科建设，解剖性肺叶切除联合射频消融治疗多发性磨玻璃结节走在省内的前列。
第七名：安徽中医药大学第一附属医院-胸外科
安徽中医药大学第一附属医院的胸外科是以治疗胸壁、食管、肺、纵隔、心脏疾病为特色的专业科室，开展胸心外科常见病、多发病、疑难病症的治疗和研究。该科在对食道及贲门疾病、肺及胸膜疾病、纵隔及膈肌疾病、胸壁疾病、胸部损伤等疾病的诊治上，除运用手术诊疗以外，还结合中医药的特色治疗，取得了满意的治疗效果。
第八名：安徽省第二人民医院-心胸外科
安徽省第二人民医院的心胸外科是集医疗、教学、科研为一体的特色学科，现已开展各类常规及复杂胸心外科手术，其中微创手术占比超过90%。该科室能够熟练开展各种肺、食管、纵隔疾病的微创治疗，擅长胸部外伤危重症及连枷胸的外科治疗。心脏方向能够开展多种先心病矫治、心脏瓣膜置换、冠状动脉搭桥等复杂手术。
第九名：安徽医科大学第一附属医院北区-胸心外科
安徽医科大学第一附属医院北区的胸心外科是医院重点发展的科室之一。胸心外科中结合OrVil系统的全胸腹腔镜下食管癌Ivor-Lewis术（简称OrVil手术）为科室的特色项目，其中OrVil手术量已超过700台，目前例数排名世界第一。同时能开展其他各类手术，如食管裂孔疝修补+Nissen抗返流术、膈膨出折叠术、食管巨大憩室切除手术等诊治。