重庆胸外科比较厉害的三个医院是陆军军医大学第一附属医院、重庆医科大学附属第一医院、陆军军医大学新桥医院。
陆军军医大学第一附属医院胸外科是国家级重点学科，是重庆唯一有心脏移植资质的单位，多项技术达国内先进水平。重庆医科大学附属第一医院胸外科心脏大血管外科是国家临床重点专科，学科水平国内先进、重庆领先。陆军军医大学新桥医院胸外科是国家重点学科，是国内最早开展胸外科手术的科室之一。
1、陆军军医大学第一附属医院 胸外科
陆军军医大学第一附属医院胸外科是西南医院重点发展的主流科室，2007年获批国家级重点学科，是国家首批心脏移植指令性开展单位、重庆唯一具有心脏移植资质的学术单位，也是研究生培养单位。科室率先开展多项国内及西南首例新技术，心脏移植、ECMO支持等水平达国内先进，冠脉搭桥术居西南领先，主持多项国家级、省部级科研课题。
2、重庆医科大学附属第一医院 胸外科心脏大血管外科
重庆医科大学附属第一医院胸外科心脏大血管外科是新中国最早创建的胸心外科之一，是国家临床重点专科、重庆市临床重点学科等，拥有多项资质头衔。学科积淀深厚，微创手术率达95%以上，医疗学术水平西南及全国知名，师资雄厚且多有国内外进修经历，发表大量SCI论文，承担多项科研课题，获多项专利及奖励。
3、陆军军医大学新桥医院 胸外科
陆军军医大学新桥医院胸外科是国家重点学科、重庆市重点学科，是博硕士学位授予点，由我国胸外科开拓者创建，是国内最早开展胸外科手术的科室之一。科室以肺外科、食管外科等为攻方向，开展多项高难度手术，全科医师均为医学博士，获多项重庆市成果奖，承担多项科研课题，手术质量及水平居西南前列。
4、重庆大坪医院 胸外科
重庆大坪医院胸外科是国家教育部重点学科、国家临床重点专科，是全军唯一胸外科专科研究所、国家卫健委胸外科内镜与微创医学培训基地等，也是博硕士授权学科、博士后流动站。科室整体水平国内领先，部分技术达国际先进，拥有多名高职称专家及博硕导师，连续多年获评各级先进单位，综合实力强劲。
5、重庆医科大学附属第二医院 胸心外科
重庆医科大学附属第二医院胸心外科建科于上世纪70年代，是集医教研于一体的特色学科，2018年挂牌重庆两江胸外专科联盟副理事长单位。科室分心脏外科和普胸外科亚专业，擅长各类胸心外科疾病诊疗，开展多种高难度手术，医护力量雄厚，博士人才充足，为西南地区患者提供安全可靠的专业化医疗护理服务。
