新疆艾滋病科医院排名比较靠前的是新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院、新疆维吾尔自治区中医医院。
新疆维吾尔自治区人民医院皮肤性病科深耕性病与关联肿瘤研究，可支撑艾滋病合并皮肤病症的专业诊疗。新疆医科大学第一附属医院感染性疾病科擅长传染病重症与机会性感染救治，具备艾滋病规范诊疗技术储备。新疆维吾尔自治区中医医院中西结合皮肤病专科依托国家级中医资质，可开展艾滋病相关皮肤并发症的中西医协同干预。
1.新疆维吾尔自治区人民医院 皮肤性病科
新疆维吾尔自治区人民医院皮肤性病科是集临床、科研、教学一体的核心专科，为新疆重要的皮肤性病医师培训基地，配套设立专业皮肤性病研究所与多个精密检测实验室。科室开展百余项性病、皮肤病诊疗项目，在艾滋病关联的Kaposi肉瘤诊治研究上稳居国内领先水平，同时深耕各类性病、真菌病诊疗。科室斩获多项高级别科技奖项，承担十余项国家级与自治区级科研课题，还是多所高校硕博培养点位，持续为全疆艾滋病相关皮肤性病诊疗筑牢技术根基。
2.新疆医科大学第一附属医院 感染性疾病科
新疆医科大学第一附属医院感染性疾病科为自治区重点学科组成部分，获评院校优秀科室荣誉。科室精通各类重症感染、不明原因发热及机会性感染诊疗，开展艾滋病相关HARRT规范治疗，配备人工肝、血浆置换等先进救治技术，强化重症病例救治能力。科室承接全疆突发传染病救治与专业人才培训工作，牵头多项国家级、自治区级科研项目并斩获成果奖项，是新疆艾滋病及感染类疾病疑难重症诊疗的核心依托科室。
3.新疆维吾尔自治区中医医院 中西结合皮肤病专科
新疆维吾尔自治区中医医院中西结合皮肤病专科拥有多项国家级重点专科、国家临床重点专科资质，搭建全国名老中医药专家传承工作室。科室在知名岐黄学者引领下形成专属中医外治流派，依托成熟中西医诊疗方案，针对性处理艾滋病引发的各类皮肤并发症，以中药内服、外治结合的方式优化康复效果。科室学术底蕴深厚，团队多人获评国家级人才称号，长期引领全疆中医皮肤及关联感染病症的规范化诊疗。
4.新疆医科大学第二附属医院 皮肤科
新疆医科大学第二附属医院皮肤科为区域性皮肤性病联盟核心成员，特邀顶尖专家担任客座指导，夯实专科技术实力。科室开展激光、光学、物理及中西医结合多元疗法，精准诊治尖锐湿疣等常见性病，可对症处理艾滋病继发的各类皮肤感染、增生及色素病变。科室深耕临床教学工作，严格执行标准化诊疗流程，凭借规范的施治方案与优质服务，为相关性病及艾滋病皮肤伴随症状患者提供可靠诊疗支持。
5.新疆医科大学第五附属医院 感染科
新疆医科大学第五附属医院感染科独立开设艾滋病咨询专项门诊，符合传染病专业诊疗隔离标准，是本地医师规范化培训及高校教学实习定点科室。科室骨干医护均赴国内顶尖传染病机构进修深造，熟练掌握艾滋病咨询筛查、基础干预及关联合并症诊疗技术，同时承担区域突发传染病防控与筛查工作。科室深耕科研教学，产出多篇高水平学术论文，以完备的诊疗体系，保障区域内艾滋病基础诊疗与健康咨询服务落地实施。
