淮南医院排行榜中排名靠前的有淮南市第一人民医院、淮南新华医疗集团新华医院、安徽省淮南市东方医院集团总院。其中淮南市第一人民医院建设的“临床基因与研究实验室”是省内市级三甲医院唯一的规范实验室；淮南新华医疗集团新华医院拥有11个淮南市首批临床医学重点学科，引领地区医疗发展潮流；安徽省淮南市东方医院集团总院形成了总医院1所、分院4所、直属医院6所的“矩阵式”布局，织起了一张覆盖城乡的优质医疗网络。
第一名：淮南市第一人民医院
淮南市第一人民医院，是淮南地区唯一的公立综合性三级甲等医院，眼科为安徽省唯一眼科临床重点专科（优先发展重点专科），普外科、神经内科、护理学科为省级重点培育专科，骨科为省级重点特色专科。医院建设的“临床基因与研究实验室”是省内市级三甲医院唯一的规范实验室，“淮南市睡眠医学中心”是省内首家规范、规模性市级睡眠医学中心。
第二名：淮南新华医疗集团新华医院
淮南新华医疗集团新华医院技术力量雄厚。骨科、儿科、心胸外科、重症医学科、普外科、耳鼻咽喉科等11个学科为淮南市首批临床医学重点学科。心血管内科、脊柱科、妇产科、关节科、泌尿外科、介入科等临床科室特色更加明显，成为淮南市特色专科、龙头学科。一大批新技术、新项目成功开展，特别是心脑血管及周围血管介入技术，腹腔镜、胸腔镜、胆道镜、宫腔镜等腔镜技术，关节镜、椎间盘镜等骨科微创技术，引领地区医疗发展潮流。
第三名：安徽省淮南市东方医院集团总院
安徽省淮南市东方医院集团总院形成了总医院1所、分院4所、直属医院6所的“矩阵式”布局，织起了一张覆盖城乡的优质医疗网络。总医院以综合医疗为特色，技术雄厚，设备精良，人才济济，学科齐全，能全方位为患者提供医疗服务。肿瘤医院为三级专科医院，以肿瘤治疗、结核病防治、精神卫生、肺科等特色专科闻名于淮南及周边地区；凤凰医院位于凤台县，是一所大型三级综合性医院。