福建治疗儿童内分泌遗传代谢病及儿科相关疾病医院排名靠前的是福建省儿童医院、福建医科大学附属第一医院、福建医科大学附属协和医院。福建省儿童医院内分泌遗传代谢科业务齐全，诊疗技术先进；福建医科大学附属第一医院儿科是省级临床重点专科，集多职能于一体；福建医科大学附属协和医院儿内科是福建最早的硕博士培养基地，多个专业实力强劲。
1、福建省儿童医院 内分泌遗传代谢科
该科室拥有先进的儿童糖尿病“3C”诊疗技术，精准调糖，深受信任。常规开展甲状腺、肾上腺等多种疾病诊治，对高氨血症、高乳酸血症等疾病有高效诊治流程。与上海儿童医学中心共建罕见病数据库，联合诊治多种罕见遗传代谢疾病。学科带头人实力强劲，为众多患儿带来康复希望。
2、福建医科大学附属第一医院 儿科
儿科作为国家综合癫痫中心核心科室、国家级儿科住院医师规范化培训基地等，光环众多。设有多个专业门诊和检查室，承担多项科研项目，发表众多论文，获多项科技成果奖。在癫痫、神经系统疾病、儿童哮喘等诊治方面经验丰富，为患儿提供全面优质医疗服务。
3、福建医科大学附属协和医院 儿内科
该科室福建最早的儿科学硕博士培养基地，也是国家级儿科医师规范化培养基地。儿童医学心理学专业为省内儿科唯一领先特色专业，多个专业为国家合作点或联盟牵头单位。综合实力强，在疑难重症疾病救治能力上突出。近年来承担多项科研课题，获多项成果奖，专家在多个学术组织任职，推动儿童身心健康做出突出贡献。
4、福建省立医院 儿科
儿科是福建医科大学等多所院校教学基地，国家级住院医师规范化培训基地。科室前辈叶孝礼教授获首届中华医学会儿科“终身成就奖”。获得多项政府科技进步奖，承担近20项科研基金项目。小儿神经、呼吸、心血管、内分泌等专科特色鲜明，拥有先进设备，收治多种儿童疾病，全心全意为孩子服务。
5、福建医科大学附属福州市第一总医院 儿科
该科室依托医联体覆盖基层医疗单位，设有多个亚专科。是福州市新生儿重点专科、国家住院医师儿科规范化培训基地等。学术研究及科研基础较好，省市立项课题13项。全面开展新生儿疾病诊治及重症监护，开展多项特色技术，在新生儿急救等临床研究方面全省领先，学科建设等居市内领先地位。
