重庆医院皮肤科排名第一的是陆军军医大学第一附属医院，该医院肤科由新中国皮肤科学的先驱和开拓者之一宁誉教授任首届皮肤科主任，是重庆市重点学科、重庆市皮肤性病研究所、国家级皮肤医疗美容示范基地。另外，重庆医科大学附属第一医院皮肤性病科被重庆市教委批准为重点学科；陆军军医大学新桥医院皮肤科是拥有皮肤病与性病学专业博士学位授予权的特色学科。
第一名：陆军军医大学第一附属医院-皮肤科
陆军军医大学第一附属医院皮肤科由新中国皮肤科学的先驱和开拓者之一宁誉教授任首届皮肤科主任，目前成为国家临床药品研究基地皮肤性病专业、重庆市皮肤性病研究所、重庆市重点学科、国家级皮肤医疗美容示范基地，长期开展皮肤病理及免疫病理研究，保持疑难病例诊断水平在国内领先；在国内最早建立的皮肤狼疮试验（LBT）成为系统性红斑狼疮诊断指标之一；医学真菌鉴定及感染防治研究、有关念珠感染和曲霉感染早期快速诊断方法在国内建立与应用最早。
第二名：重庆医科大学附属第一医院-皮肤性病科
重庆医科大学附属第一医院皮肤性病科是建院初期首批开设的临床科室之一，被重庆市教委批准为重点学科，科室医疗技术、专业队伍、科室规模和学科影响力得到快速发展，开设七个特色专病门诊，在重庆地区处于领先地位，形成较强的区域影响力。CMI值（即病例组合指数，该值越高，疑难病例越多）一直保持重庆市第一的位置。
第三名：陆军军医大学新桥医院-皮肤科
陆军军医大学新桥医院皮肤科集医疗、教学和科研为一体，是拥有皮肤病与性病学专业博士学位授予权的特色学科，先后获得国家自然科学基金、中华医学会皮肤科学会科研基金、重庆市自然科学基金等资助课题10余项，并具有多项专科诊疗技术。
第四名：重庆大坪医院-皮肤性病科
重庆大坪医院皮肤性病科诊疗项目包括病毒性、细菌性、真菌性皮肤病以及寄生虫、昆虫等动物性皮肤病，尤其是特殊性及难治性皮肤感染病的诊疗水平在全国领先。科室研究方向明确，成绩斐然，发表国内统计源期刊论文百余篇，国外SCI收录论文三十余篇。
第五名：重庆医科大学附属第二医院-皮肤科
重庆医科大学附属第二医院皮肤科目前已成为皮肤性病学医疗、教学、科研中心，是重庆市级重点学科，也是皮肤性病住院医师培训基地，能够为广大皮肤性病患者提供诊疗。科室技术力量雄厚、人才结构较合理、医疗设备较齐全，整体医疗水平较高，在重庆市渝中区人民群众中享有较高地位。
第六名：重庆市人民医院-皮肤科
重庆市人民医院皮肤科是医院早期开设的一级主要科室之一，为了有效地防治皮肤及泌尿性病，更好地方便和满足患者就医，重庆市人民医院抽调了临床经验丰富、医疗技术高超的专家新组建了由皮肤科、男性科、女性科、男性学科组成的皮肤性病科。
第七名：重庆市公共卫生医疗救治中心-皮肤科
重庆市公共卫生医疗救治中心皮肤科配有点阵二氧化碳激光、红蓝光治疗仪、伍德氏灯、冷热熏蒸机等先进仪器设备，诊疗疾病包括痤疮、扁平疣、湿疹、皮炎、脱发及各类过敏性、瘙痒性、角化性、色素性等皮肤病，和梅毒、尖锐湿疣等性病。
第八名：重庆市第九人民医院-皮肤科
重庆市第九人民医院皮肤科是集医疗、教学、科研、预防为一体的专业科室，科室技术力量雄厚，皮肤内科常见、疑难皮肤病的治疗，另外还擅长皮肤美容，比如调Q激光治疗雀斑、黄褐斑、脂溢性角化症等，其中专科技术（核心技术）为自体疣皮下埋植、调Q激光等。
第九名：重庆市第五人民医院-皮肤科
重庆市第五人民医院皮肤科是重庆市南岸地区技术力量最强、医疗仪器设备最先进的专科之一，对皮肤科疾病的诊断、治疗拥有丰富的临床经验和较高的学术水平。现己发展成为集医、教、研为一体的一级临床科室，在南岸区处于领先水平。