治疗苯丙酮尿症建议就诊于内分泌科。北京治疗苯丙酮尿症前三甲医院为北京协和医院内分泌科、中国人民解放军总医院内分泌科、北京医院内分泌科。北京协和医院内分泌科依托悠久历史积淀，在代谢病临床研究领域根基深厚；解放军总医院内分泌科以重点实验室和特色诊疗为支撑，罕见代谢病诊治能力突出；北京医院内分泌科凭借强大学科传承与多科协作，诊疗水平国内知名。
1、北京协和医院 内分泌科
内分泌科伴随医院发展，仿照国际顶尖医院模式开展内分泌代谢疾病临床研究。作为国内内分泌领域标杆科室，在苯丙酮尿症等代谢性罕见病的诊断、临床评估及规范化治疗方面积累了深厚经验，诊疗水平稳居国内领先行列，学科影响力辐射全国。
2、中国人民解放军总医院 内分泌科
内分泌科为全军内分泌代谢病重点实验室、国家新药临床研究中心，2008年获评北京重点学科，获多项军队及省部级科技进步奖。以内分泌代谢系统罕见病及疑难病诊治为特色，在苯丙酮尿症等代谢病的临床识别、治疗随访及基础研究方面实力雄厚。
3、北京医院 内分泌科
内分泌科是北大医学部、协和医科大学博士学位授予点，依托卫生部老年医学研究所、临床医学检验中心，相关激素检测水平全国领先。学科传承深厚，知名专家云集，通过多科协作在代谢病并发症干预研究方面成果显著，对苯丙酮尿症等罕见代谢病的诊疗具备独到优势，诊疗技术达国内先进水平。
4、北京大学第一医院 内分泌内科
内分泌内科为“国家重点专科建设项目”科室，拥有多名全国知名专家，对内分泌代谢病诊断治疗水平国内领先。承担多项国家攻关及重点研究课题，在代谢病基础与临床研究领域成果丰硕，能快速诊断包括苯丙酮尿症在内的少见及疑难代谢病，为患者提供规范化诊疗方案。
5、北京大学第三医院 内分泌科
内分泌科为2023年度国家临床重点专科建设项目，连续多年获复旦版专科声誉排行榜提名。学科在胰岛功能、代谢病基础研究领域国内领先，多篇论文发表于国际高水平期刊。对苯丙酮尿症等代谢病诊治经验丰富，拥有完善的诊疗体系，科内专家在全国多个内分泌学会担任重要职务，学术影响力突出。
