咸阳市中心医院擅长的科室有神经内科、心内科、生殖医学科、肝胆外科、耳鼻咽喉科等。
1、神经内科
咸阳市中心医院神经内科，是以脑血管病防治、神经危重症救治为主的专科，科室配备神经内科重症监护室、脑电图室、眼需电图室、臭氧治疗室、血压指脉氧监护、无创颅内压监测，全自动进口电脑控制呼吸机3台，电动翻身床、电动排痰仪等。目前科室可开展的工作有：急性缺血性脑血管病超早期动静脉溶栓治疗、介入取栓、颈动脉支架植入术，早期抗凝治疗、脑出血及其他脑血管疾病等。
2、心内科
咸阳市中心医院心内科，配有先进完善的监护救治设备和强有力的诊疗小组，使心血管急、危、重症患者能够得到及时有效的诊断与治疗。科室对急性心肌梗死、急性主动脉夹层、急性肺动脉栓塞等高危胸痛及恶性心律失常、顽固型心力衰竭、心源性休克、重症心肌炎等心血管急危重症的救治有很高的成功率，在咸阳地区居于领先水平。
3、生殖医学科
咸阳市中心医院生殖医学科，主要在治疗男女不孕症、复发性流产及生殖内分泌疾病诊治领域卓有成就，在咸阳市处于领先地位。科室开设了不孕症男科门诊、女科门诊；习惯性流产门诊；男女再生育咨询门诊；高龄夫妇生育健康咨询门诊；男女性孕前保健各询门诊；男女生殖健康评估门诊；更年期综合征门诊、月经病门诊等。
4、肝胆外科
咸阳市中心医院肝胆外科，现拥有进口B超、3D腔镜、超高清容镜、十二指肠镜、超声内镜、阳道境、液电容石仪、肿瘤微波消肿仪、肿瘤封锁治即仪、肝阳个入设备、重症监护仪等先进仪器设备。科室可以完成隐容错院十二指肠切除、腹腔镜半肝切除、隐容捐胆囊很相治、隐肿镜肝门部阳管癌根治、隐容错除体里切除、腹容错障管切干即石隙管容肠吻合术、腹腔镜下胆管修复重建、腹腔镜脾切除贲门周围血管离段术等复杂手术，技术达到国内先进，区域领先水平。
5、耳鼻咽喉科
咸阳市中心医院耳鼻咽喉科，科室设备先进，现拥有德国进口超高清鼻内窥镜手术系统、日本进口电子喉镜及显像系统、可调节支撑喉镜、等离子高频手术治疗仪、德国MAICO纯音听闻检测仪、声阻抗仪、耳声发射分析仪等设备。可开展鼻窦炎的手术治疗；耳显微镜下且道肿物切除术、鼓膜穿孔修补术、鼓膜置管术、乳突根治术及新生儿耳廓畸形无创矫正；支撑眼镜及电子喉镜下喉部肿物、会厌肿物切除术及喉部恶性肿瘤的个性化综合治疗。