合肥眼科医院比较好的是安徽医科大学第一附属医院、安徽省立医院、安徽医科大学第二附属医院，安徽医科大学第一附属医院眼科是安徽省最早获得硕士授予权的学科之一，一直保持着在安徽省眼科的龙头地位。安徽省立医院眼科目前是眼科硕士研究生授予点；安徽医科大学第二附属医院眼科是安徽省医学会眼科学分会候任主委单位。
第一名：安徽医科大学第一附属医院-眼科
安徽医科大学第一附属医院眼科是安徽省最早获得硕士授予权的学科之一。1997年被省卫生厅评为全省卫生系统重点科室，迄今为止已经两次通过卫生厅检查验收，一直保持着在安徽省眼科的龙头地位。专业分组齐全，设有白内障、青光眼、眼底病、斜视弱视、眼整形及眼眶病等亚专科。现能熟练地开展三级甲等医院重点专科的诊疗技术，接受处理全省各地及外省市转来的复杂、疑难、危重病例。
第二名：安徽省立医院-眼科
安徽省立医院眼科目前是眼科硕士研究生授予点，省防盲技术指导中心所在单位，眼科专科医师基地单位，合肥市防盲手术定点医院，《实用防盲技术》杂志编辑部所在单位，在安徽省内及周边省市具有很高的知名度和影响力，总体实力居省内一流水平。医生总体学历水平较高，职称结构合理，医护人员配备能够满足工作和发展需要。各级医师都能够熟练掌握相应技术，形成技术团队，处理疑难重症能力强。
第三名：安徽医科大学第二附属医院-眼科
安徽医科大学第二附属医院眼科是医院重点发展专科，安徽省眼科学硕士学位和临床医学博士学位授予点，博士后流动站合作科室，安徽省医学会眼科学分会候任主委单位。眼科开展的诊疗项目广泛，有白内障超声乳化联合人工晶体植入术、飞秒激光及ICL等屈光手术、微创玻璃体切除术、视网膜脱离复位术、斜视弱视矫治、各种复杂青光眼的诊治、鼻内镜及泪道内窥镜手术、眼睑眼眶整复术、复杂眼外伤修复手术和其它眼表眼底疾病的综合治疗，其中斜弱视综合治疗、泪道内窥镜微创手术、高度近视后巩膜加固手术、难治性青光眼引流阀引流钉植入以及复杂眼外伤的修复手术等处于省内领先水平。
第四名：合肥市第一人民医院-眼科
合肥市第一人民医院眼科是集医疗、教学、科研防盲为一体的医学二级学科。目前拥有床位40张，下设白内障诊疗中心和飞秒激光治疗中心，年门诊量4万人次，年手术量3000余例。眼科2008年被评为安徽省第三周期临床重点发展学科，2010年被评为合肥市第三周期重点学科。2021年荣获国家眼部疾病临床研究中心授牌“光明中心”。眼科是安徽省“白内障复明工程”定点科室，曾获得全国防盲先进单位。
第五名：合肥市第二人民医院-眼科
合肥市第二人民医院眼科现已发展成为集医疗、教学、科研和防盲治盲于一体的院级重点科室。专业分组较齐全，设有视光中心、白内障、青光眼、玻璃体视网膜疾病、眼整形以及泪道疾病等亚专科。目前已开展白内障超声乳化手术、青光眼内外路引流手术、视网膜脱离复位手术、糖尿病视网膜病变激光和微创玻璃体切割手术、严重眼外伤修补及球内异物取出术，泪小管断裂吻合术、鼻内镜下鼻腔泪囊吻合手术等诊疗技术。