湖南省妇幼保健院擅长新生儿科、重症医学科、乳腺外科、皮肤与性病科、心理卫生科，这些科室学科特色鲜明，优势明显，可为患者提供高水平、高质量的诊疗服务。
1、新生儿科
为院级重点学科、湖南省危重新生儿救治中心，和湖南省儿童医院协同成为国家新生儿专科医师培训基地。现已发展成为具有新生儿重症监护病房、新生儿内科、新生儿筛查中心等完整的专业体系，形成了具有较大优势的技术特色，新生儿专业的发展达到省内先进水平。
2、重症医学科
是湖南省成立最早的妇产专科ICU，担负着全院所有急危重症惠者的救治工作。科室拥有进口多功能监护仪、有创、无创呼吸机、便携式超声等多种高端医疗设备，可常规开展各类高级呼吸、循环功能支持治疗，血栓弹力图凝血功能检测等技术。
3、乳腺外科
是湖南省乳腺疾病防治中心、湖南省妇幼保健与优生优育协会乳腺保健专业委员会主席单位、湖南省中医药和中西医结合学会乳腺病专业委员会副主席单位、湖南省乳腺癌专病联盟副主席单位、中国妇幼保健协会乳腺微创旋切技术培训中心。
4、皮肤与性病科
是国内妇幼系统较早开设皮肤病与性病专科门诊之一。皮肤科门诊开展了孕产妇及儿童常见皮肤病诊疗，为广大妇女儿童提供了安全、有效、可靠的医疗服务。开展了个体化的综合疗法治疗痤疮、敏感肌，采用中西医相结合的综合方法治疗带状疱疹及其后遗神经痛等特色疗法。
5、心理卫生科
科室在全国妇幼医疗系统中率先开展心理工作，为个体/团体提供全生命周期的精神卫生、临床心理干预与保健服务。科室团队在长期为大量妇女儿童解除心理痛苦的临床工作中总结了丰富的心理咨询、心理治疗、药物治疗等精神卫生医疗服务相关经验，掌握国际最前沿心理咨询技术。特别擅长用心理治疗方法解决焦虑、抑郁、强迫等神经症、女性性心理障碍等心理问题。