郑州市中医院擅长骨科、儿科、肾病科、风湿免疫科、脑病科等。这些科室设备齐全、技术力量雄厚，可以为患者提供高水平的治疗。
1、骨科
郑州市中医院骨科是市中医重点专科，主要治疗的疾病有脊柱、骨盆及四肢等各部位骨折、关节脱位及运动损伤、腰椎间盘突出症、腰椎管狭窄症、腰椎滑脱、手、足部外伤导致的肌腱、血管、神经损伤及断肢再植等。骨科除了保持中医中药特色治疗的特点外，紧跟现代医学科技发展的步伐，用更加科学有效的方法服务患者。
2、儿科
郑州市中医院儿科是国家“十二五”重点专科建设单位，科室积极开展绿色中医外治特色疗法，致力将安全绿色的纯正中医疗法应用于广大患儿，配制有多种疗效好、副作用小、价格低廉的丸、散、膏、丹中药制剂。膏药贴敷、中药结肠滴注、中药熏洗、推拿按摩、穴位埋线、耳穴压豆、揿针等中医外治是科室的一大特色。擅长运用中西医结合治疗小儿肺系、脾系、脑病、新生儿等多种疾病，中医特色治疗达到100%。
3、肾病科
郑州市中医院肾病科是省重点专科建设单位，科室采用中西医结合治疗方法治疗各种肾脏疾病和风湿性疾病，开展的中医特色治疗项目有中药直肠滴入、中药离子导入、中药塌渍、中药熏洗、蜡疗、穴位贴敷、穴位注射、电针、温针、脐火灸、盘龙灸和悬灸等。
4、风湿免疫科
郑州市中医院风湿免疫科是省重点专科建设单位，中医优势突出，采用中西医结合疗法治疗各种风湿病疗效显著。开展的中医特色治疗项目有：中药直肠滴入、中药离子导入、中药塌渍、中药穴位贴敷、针刺和艾灸及各种穴位注射等。采用中西医结合治疗方法治疗各种风湿性疾病如：系统性红斑狼疮、干燥综合症、多发性肌炎、系统性硬化症、混合性结缔组织病、类风湿关节炎、骨性关节炎等。
5、脑病科
郑州市中医院脑病科是国家“十一五”重点专科，坚持中西医结合的方针，以中医治疗为主，西医为辅的原则，集脑病的抢救、药物治疗、心理治疗、康复和健康教育于一体。擅长多病高龄老人的个体化治疗、帕金森病的中西医结合治疗，头痛、痴呆、疱疹性神经痛、面肌痉挛、周围神经病等疾病诊治。
