重庆胸外科医院排名第一的是陆军军医大学第一附属医院、重庆医科大学附属第一医院、陆军军医大学新桥医院等。陆军军医大学第一附属医院胸外科为国家首批心脏移植的指令性开展单位。重庆医科大学附属第一医院胸外科/心脏大血管外科是新中国最早创建的胸心外科之一。陆军军医大学新桥医院胸外科是国家重点学科，形成鲜明特色和国内领先优势。
第一名：陆军军医大学第一附属医院-胸外科
陆军军医大学第一附属医院胸外科为国家首批心脏移植的指令性开展单位，是重庆地区唯一具有开展心脏移植资质的学术单位。率先在国内和西南地区开展了一系列新技术，包括我国首例心肾联合移植术、我国首例激光心肌打孔术、我国首例微波射频治疗肺癌、西南地区首例冠状动脉搭桥术和西南地区首例微创切口非体外循环冠状动脉搭桥术、西南地区首例使用双极射频治疗系统进行的迷宫手术。
第二名：重庆医科大学附属第一医院-胸外科/心脏大血管外科
重庆医科大学附属第一医院胸外科/心脏大血管外科是新中国最早创建的胸心外科之一，分为肺外科，食管外科，纵隔外科，创伤外科等亚专科。擅长肺部疾病、食管疾病及纵隔肿瘤的外科治疗，重症胸外伤的救治等，整体医疗技术水平在西南地区及全国都有很高地位及影响，学科发展属国内先进，重庆市领先水平。在国内外权威杂志上发表学术论文500余篇，多篇被SCI收录；参编各种专著10余部。
第三名：陆军军医大学新桥医院-胸外科
陆军军医大学新桥医院胸外科是国家重点学科，以食管外科、肺外科、重症肌无力外科、肺结节诊疗及胸腔镜微创外科为主攻方向。形成鲜明特色和国内领先优势。科室本着基础研究与临床诊治并重的原则，先后开展了胸部肿瘤的微创手术、晚期肺癌扩大化手术治疗、慢阻肺肺减容术、颈段食管癌根治、纵隔巨大肿瘤切除、婴幼儿胸壁巨大肿瘤切除及新生儿先天性膈疝修补等国内外高难度手术。并已施行心肺联合移植手术。
第四名：重庆大坪医院-胸外科
重庆大坪医院胸外科为国家教育部重点学科、卫生部胸外科内镜与微创医学培训基地、重庆市首批医学重点学科、重庆市胸外科医疗质量控制中心。学科主要收治肺疾病、食管疾病、纵隔疾病、重症肌无力及胸膜胸壁疾病患者，近年来以胸腔镜、腹腔镜和纵隔镜等微创技术为发展重点，微创手术率达75%以上，并立足西南、辐射全国，创新开展了全国或国际领先的多项新业务、新技术。学科整体为国内领先水平，部分学术技术达到国际先进水平。
第五名：重庆医科大学附属第二医院-胸心外科
重庆医科大学附属第二医院胸心外科诊疗技术先进，已经形成心脏外科和普胸外科两个亚专业，为西南地区的胸心外科患者带来了安全可靠的医疗和护理服务。擅长先天性心脏病：房间隔/室间隔缺损修补术；瓣膜病变：瓣膜置换术、瓣膜成型术；大血管病变：动脉置换术、夹层支架置入术；冠脉疾病：冠脉搭桥；心脏肿瘤：粘液瘤摘除术。
第六名：重庆市人民医院-胸外科
重庆市人民医院胸外科是我市乃至全国较早开设的胸外科专科之一，在西部地区率先开展食管疾病、肺结核及肺肿瘤的外科治疗。目前重庆市人民医院获批成为重庆市心肺血管疾病医疗研究中心。获评复旦大学医院管理研究所发布的“2017年度七大区域医院专科声誉排行榜”西南区胸外科专科提名医院。
第七名：重庆市公共卫生医疗救治中心-胸外科
重庆市公共卫生医疗救治中心胸外科是西南地区较早开展肺叶切除手术及胸部感染性疾病外科治疗的科室，能高水平完成普胸方面肺、纵隔、胸廓等感染性疾病的诊断及手术治疗，在西南地区处于领先地位，特别在耐药结核病、结核性脓胸、结核性气胸及胸部结核的严重并发症方面的外科诊疗是该科特色，累了丰富的临床经验。在中华胸心血管外科及其他核心期刊发表相关论文多篇。
第八名：中国人民解放军陆军第九五八医院-心胸外科
中国人民解放军陆军第九五八医院心胸外科为医院重点科室，拥有多台先进的进口医疗设备。主要收治：各种食管疾病、肺部疾病、纵隔胸膜疾病、先天性心脏病、风湿性心瓣膜病。科室特色：体外循环下心脏不停跳行先天性心脏病矫治术，风湿性心脏病瓣膜置换术，微创胸腔镜肺叶切除术等。
第九名：重庆市第九人民医院-心胸外科
重庆市第九人民医院心胸外科是重庆北部地区唯一的心胸外科，科室主要设备有体外循环机、呼吸机、多功能心电监护仪、除颤仪等。主要业务范围是，各种先天性的心脏疾病手术治疗及风心病的单瓣膜及双瓣膜置换手术，各种肺部肿瘤、肺癌、纵隔肿瘤、重症肌无力的手术治疗及各段食管癌、贲门癌的手术治疗及贲门失弛缓症的手术治疗都有着较好的效果。自发性气胸的胸腔镜手术及腋下小切口的手术有创伤小，住院时间短等优点。
第十名：重庆市南川区人民医院-胸外科
重庆市南川区人民医院胸外科设备先进，目前能独立开展肺癌、食管癌、纵隔肿瘤等疾病的根治性手术，取得较好的临床效果。主要开展了胸腔镜下的肺大疱切除术、纵隔肿瘤切除术、肺癌根治术；手汗症等；我科在胸部外伤的救治取得良好的效果，大批重症胸部外伤的病人得到及时，有效的治疗；特别是连枷胸、肺挫伤、心脏开放性损伤等。
