乌鲁木齐眼科医院比较好的是新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学一附属医院、新疆医科大学第二附属医院，新疆维吾尔自治区人民医院的眼科具有较高声誉和影响力，常年有国内顶尖眼科专家眼科坐诊、手术，有多个亚专业。新疆医科大学一附属医院眼科有相当丰富的临床经验和精湛的医疗技术；新疆医科大学第二附属医院眼科有先进设备，可开展多种眼部手术。
第一名：新疆维吾尔自治区人民医院-眼科
新疆维吾尔自治区人民医院眼科在全疆有着广泛协作资源和平台，具有较高声誉和影响力，并与广州中山眼科中心建立密切的学术合作，常年有国内顶尖眼科专家眼科坐诊、手术。有白内障、青光眼、眼底病、眼外伤、眼表疾病、屈光及眼肌、小儿眼科，眼眶整形、葡萄膜病、神经眼科等亚专业。2017年率先在全疆开展日间手术。
第二名：新疆医科大学第一附属医院-眼科
新疆医科大学一附属医院眼科对各类疑难复杂眼部疾病的诊断及治疗已有相当丰富的临床经验和精湛的医疗技术。眼科现已形成了眼前、后节、斜弱视及眼眶病4个亚专业，白内障超声乳化术及手法小切口白内障摘除手术技术娴熟，对疑难复杂白内障手术具有丰富的临床经验。
第三名：新疆医科大学第二附属医院-眼科
新疆医科大学第二附属医院眼科是集医疗、教学、科研为一体的临床科室，配有OCT、眼底造影机、自动视野计、532激光、手术显微镜、玻切超乳一体机等检查及治疗设备，开展了白内障、青光眼、玻璃体及视网膜疾病、斜视、眼外伤等多种眼部手术。
第四名：新疆医科大学第五附属医院-眼科
新疆医科大学第五附属医院眼科现已成为集医疗、教学和科研于一体的新疆自治区内知名眼科，眼科住培基地，白内障复明基地，小儿斜弱视诊疗中心，青少年近视防控中心。科室拥有全国知名专家原青岛眼科研究所白内障专家曹景教授及青岛眼科研究所小儿斜弱视专家宫华靑教授成立名医工作室，定期来院开展诊疗工作。
第五名：新疆生产建设兵团总医院-眼科
新疆生产建设兵团总医院眼科是北京协和医院眼科阅片中心兵团眼科分中心，是医院重点发展的学科之一，常规开展白内障、青光眼、玻璃体视网膜病、眼表与角膜病、泪道疾病、眼外伤、斜弱视、屈光不正及小儿眼病的诊治。尤其在复杂性白内障和难治性青光眼手术、玻璃体切除联合增殖膜撕除术、复杂视网膜脱离修复术、眼底病抗VEGF和激光治疗方面有丰富的临床经验。
第六名：乌鲁木齐市友谊医院-眼科
乌鲁木齐市友谊医院眼科自2003年3月成立中美合作麦格眼科中心之后，床位扩大为30张，自96年开展白内障超声乳化术已行数万例，在全疆享有很高的知名度。友谊医院眼科中心准分子激光手术治疗近视，已行近千例。同时开展的非穿透小梁切除，泪小管硅胶逆行植入术等，也为本科特色手术。对于眼眶肿瘤、眼底病、斜视弱视等常见眼科疾病有丰富的经验。
第七名：新疆军区总医院北京路临床部-眼科
新疆军区总医院北京路临床部眼科主要收治视网膜脱离、视网膜血管性疾病、玻璃体出血以及新生血管性青光眼等眼科疾病的治疗。视网膜脱离采用当今国际上流行的间接眼底镜下冷凝＋激光治疗法，收到了较好的治疗效果。视网膜血管性疾病采用日本进口的托普康50IX荧光造影协助诊断、配合激光治疗，对被认为根本无法治疗的疾病开辟了新天地，特别为糖尿病视网膜病变患者重见光明带来了希望。
