昭通医院排名靠前的有昭通市第一人民医院、昭通市中医医院、镇雄县人民医院等。其中昭通市第一人民医院是昭通市临床检验中心、肿瘤综合治疗中心、昭通市全科医生培训基地和实习基地；昭通市中医医院拥有国家级重点专科2个、省级重点专科3个、省级中医特色专科4个等；镇雄县人民医院是昭通市唯一一个助理全科医生规范化培训基地，拥有9个省级临床重点专科建设项目。
第一名：昭通市第一人民医院
昭通市第一人民医院已发展成为昭通市最大而唯一一所集医疗、急救、预防、保健、康复、科研、教学为一体的国家三级甲等综合医院，是昭通市临床检验中心、“120”急救中心、血管微创治疗中心和肿瘤综合治疗中心、职业健康体检医院、昆明医科大学教学及实习医院、司法鉴定中心、临床医学硕士研究生教学基地、昭通市全科医生培训基地和实习基地，承担着该市及相邻川、黔地区600余万人口的医疗救治、康复和保健任务。
第二名：昭通市中医医院
昭通市中医医院系三级甲等中医医院、云南中医药大学附属医院，其中有国家级重点专科2个、省级重点专科3个、省级中医特色专科4个、省级重点学科1个、省级区域中医诊疗中心2个、省级中医临床医学中心协作单位3个、院级重点专科4个、院级重点专科在建13个。引进硕士研究生较多，位列全市卫健系统第一，占全市卫健系统的55%，DRGs出院人数位列全省中医医院第一。
第三名：镇雄县人民医院
镇雄县人民医院连续多年荣获县级文明单位、市级文明单位荣誉称号，2012年荣获国家原卫生部、国家中医药管理局、国家人力资源和社会保障局授予的“全国卫生系统先进集体”称号。现有5个县级重点专科，9个省级临床重点专科建设项目，是昭通市唯一一个助理全科医生规范化培训基地、昭通市第一个通过“县级医院医疗服务能力”提质达标建设的医院，昭通市第一个晋级为“三级综合医院”的县级医院。