安康市中心医院擅长的科室有消化内科、心血管内科、神经内科、呼吸与危重症医学科、新生儿科等，这些科室设备齐全、技术力量雄厚，可以为患者提供高水平的治疗。
1、消化内科
安康市中心医院消化内科是陕西省优势医疗专科、安康市重点医学专科，可开展消化道、肝胆、胰腺等消化系统疾病的临床诊治，内镜诊治、放射介入、超声介入、胃肠功能检查。诊疗特色有腹部超声、胃肠动力及常规内镜检查，食管胃底曲张静脉硬化、套扎，食道支架/碘125粒子支架置入术、早期食管癌粘膜切除术（ESD、EMR）、ERCP取石/蛔虫术、胆道金属支架、多支架置入、胆道镜液电碎石等内镜下治疗技术等。
2、心血管内科
安康市中心医院心血管内科是省级临床重点专科，多次被评为全市“青年文明号”，在科研上科室主持完成的“经桡动脉介入治疗冠心病的临床研究”荣获陕西省科技进步三等奖，全市科技进步一等奖。擅长各类高血压、冠心病、大血管疾病主动脉夹层、胸腹主动脉瘤的腔内隔绝治疗，先天性心脏病的介入封堵治疗，心脏起搏治疗，外周血管疾病、动静脉血栓的诊治等心血管疾病的诊治。
3、神经内科
安康市中心医院神经内科是安康市市级临床重点专科，陕西省临床重点专科建设单位，脑防委脑血管病筛查基地、脑出血微创治疗协作单位。在医院先进设备支撑下，应用微创锥颅技术治疗脑出血，脑室穿刺引流技术治疗高颅压脑积水，全脑血管造影、介入技术治疗各种脑血管疾病；静脉溶栓、动脉取栓技术治疗急性脑梗死，血浆置换、免疫疗法治疗格林巴利、多发性硬化、重症肌无力等危急重症。
4、呼吸与危重症医学科
安康市中心医院呼吸与危重症医学科，于2007年被评为安康市市级临床重点专科、2019年成为省级临床重点专科建设单位。现有中心供氧及吸引、心电监护仪、十二导联心电图机、肺功能检测仪、睡眠检查仪、呼吸机等设备，主要从事慢阻肺、哮喘、肺心病、呼吸衰竭、重症肺炎、肺间质疾病、肺栓塞、肺癌、睡眠呼吸暂停综合症等诊疗、护理和临床科研。
5、新生儿科
安康市中心医院新生儿科，2013年3月被卫生局正式任命为安康市新生儿急救中心，2014年被安康市卫生局评定为市级医学重点专科，2016年评定为省级临床重点专科，是安康市新生儿救治、教学、科研、高危儿随访为一体的新生儿专业医疗中心。该科室擅长新生儿常见病、多发病及疑难杂症的诊治。
