南昌呼吸科比较好的医院排名靠前的是南昌大学第一附属医院、南昌大学第二附属医院、江西省人民医院等。南昌大学第一附属医院呼吸科是江西省唯一一家拥有卫生部国家内镜培训基地，是江西省呼吸疾病研究所；南昌大学第二附属医院呼吸内科是江西省最早成立的呼吸学科专业科室，临床经验丰富；江西省人民医院呼吸与危重症医学科是江西省成立最早的呼吸学科专业科室，是江西省人民医院重点学科。
第一名：南昌大学第一附属医院-呼吸科
南昌大学第一附属医院呼吸科是江西省唯一一家拥有卫生部国家内镜培训基地，江西省呼吸疾病研究所，江西省重点实验室。对慢性阻塞性肺疾病，支气管哮喘，肺癌，肺栓塞，各种肺部感染性疾病：包括重症肺炎、免疫抑制合并肺部感染，胸膜疾病、甲型H1N1流感、慢性咳嗽的诊治、大咯血、呼吸衰竭的救治及各种呼吸系统疑难少见病包括：间质性肺疾病，系统性血管炎，肺泡蛋白沉积症、肺出血肾炎综合症等的诊治方面具有丰富的经验。
第二名：南昌大学第二附属医院-呼吸内科
南昌大学第二附属医院呼吸内科是江西省最早成立的呼吸学科专业科室、江西省呼吸专业最早硕士学位授予点。在急性呼吸窘迫综合征（ARDS）、慢性阻塞性肺疾病（COPD）、支气管哮喘、肺癌、感染性肺疾病等的诊治方面积累了一系列丰富的临床经验。尤其在机械通气、危重病人的抢救和肺癌的治疗方面更具优势。
第三名：江西省人民医院-呼吸与危重症医学科
江西省人民医院呼吸与危重症医学科是江西省成立最早的呼吸学科专业科室，是江西省人民医院重点学科。医疗方面接受大量常见病及疑难危重病人的救治。主要病种有，慢性阻塞状肺疾病（COPD）肺部感染（尤其是真菌感染），哮喘，肺癌，弥漫性肺间质性疾病，胸腔积液，呼吸衰竭，肺血管病，呼吸疑难杂症，不明原因发热等疾病。
第四名：南昌市第三医院-呼吸内科
南昌市第三医院呼吸内科包括普通病房、危重症监护室(RCU)、支气管镜室、睡眠呼吸监测室、肺功能室、门诊及门诊综合治疗室等7部分，开展了电子支气管镜检查、胸腔穿刺及胸膜活检、经皮肺穿刺活检术，肺功能测定，多导睡眠呼吸监测。主要从事慢性阻塞性肺疾病（COPD），支气管哮喘，肺部感染，肺纤维化，肺心痛，肺血管病，肺癌支气管扩张，感染性休克等疾病的临床教学和科研工作。
第五名：南昌大学第三附属医院-呼吸内科
南昌大学第三附属医院呼吸内科已成为一个技术力量雄厚，学术梯队合理，集医疗、教学、科研为一体的综合性临床学科。开设普通门诊、专家门诊、哮喘门诊、变态反应（过敏原）检测门诊，具有血气分析室、纤维支气管镜检查室、呼吸重症监护室，拥有肺功能监测仪、血气分析仪、纤维支气管镜、呼吸机（Bear1000ventilator，Bipap及高频振荡通气等呼吸机）等设备。
第六名：江西省中西医结合医院-呼吸内科
江西省中西医结合医院呼吸内科是省级重点中西医结合专科，擅长于纤支镜诊查术、肺泡灌洗术、经纤支镜肺活检、经皮肺穿刺、胸膜活检、胸腔闭式引流、机械通气等诊疗技术。中西医结合治疗支气管哮喘、慢性支气管炎、慢性阻塞性肺疾病、肺源性心脏病、肺癌、顽固性咳嗽等方面达江西省内先进水平。
第七名：南昌大学第四附属医院-呼吸内科
南昌大学第四附属医院呼吸内科以医院的整体设施为平台，充分利用医院影像中心、细菌室、病理科等科室的条件，紧密结合临床，围绕支气管哮喘、慢性阻塞性肺疾病（COPD）、呼吸衰竭、肺部感染、慢性咳嗽、肺癌、胸膜疾病、肺栓塞、肺间质性疾病及睡眠呼吸障碍性疾病的发病机制与防治等开展了大量的临床，教学，科研工作，并取得了显著的成绩。
第八名：江西省胸科医院-呼吸与危重症医学科
江西省胸科医院呼吸与危重症医学科擅长上呼吸道感染、慢性阻塞性肺疾病、肺心病、支气管哮喘、支气管扩张症、先天性支气管肺囊肿、先天性肺发育不全、气胸、尘肺、间质性肺疾病病、肺肿瘤等呼吸系统疑难杂症的诊断和治疗。对肺脏病介入诊治以及全麻下大容量全肺灌洗治疗尘肺、肺泡蛋白沉着症有丰富的经验；对咯血、窒息、气胸、呼衰等呼吸科急症的抢救、有创和无创呼吸机的使用有丰富的临床经验。
第九名：江西中医药大学第二附属医院-呼吸科
江西中医药大学第二附属医院呼吸科，有肺功能仪、心电图机、心电监护仪、除颤仪、无创呼吸机、有创呼吸机、电子支气管镜和吸引器等专科仪器设备，为病人的诊断和治疗提供了有力的保障。该科充分发挥中西医结合诊疗特色，以局部与整体结合、内治与外治结合、宏观与微观结合等诊疗方法，治疗慢性支气管炎、慢性阻塞性肺疾病、肺源性心脏病、支气管哮喘、慢性咳嗽、肺间质纤维化、重症肺炎、支气管扩张症、呼吸衰竭、胸腔积液等呼吸系统疾病颇具特色。
