呼和浩特医院排名靠前的是内蒙古医科大学附属医院、内蒙古自治区人民医院、内蒙古自治区国际蒙医医院等。内蒙古医科大学附属医院特色专科突出、多学科综合优势强大，享誉内蒙古。内蒙古自治区人民医院为全区最大的三级甲等综合性医院，攻克了许多疑难杂症和多项疑难手术。内蒙古自治区国际蒙医医院是目前国际上规模最大的三级甲等蒙医综合医院，是我国首家以蒙医药医疗为主的医院。
第一名：内蒙古医科大学附属医院
内蒙古医科大学附属医院，是内蒙古自治区最早建立的综合性医院之一，以学科齐全、技术力量雄厚、特色专科突出、多学科综合优势强大享誉内蒙古，是一所承担着医疗、急救、教学、科研、预防、保健和康复任务的三级甲等医院。医院现有国家临床重点建设专科3个，分别是神经外科学、普通外科学和蒙医科学。
第二名：内蒙古自治区人民医院
内蒙古自治区人民医院，现已成为集医疗、科研、教学、预防、保健、急救为一体的全区最大的“三级甲等”综合性医院。除诊治常见病、多发病、地方病、职业病外，积极运用高、精、尖技术，攻克了许多疑难杂症和多项疑难手术，填补了许多自治区医学空白。如已开展的异体肝移植手术、肾移植手术、心内介入技术、分子治疗技术、心脏瓣膜置换术等。
第三名：内蒙古自治区国际蒙医医院
内蒙古自治区国际蒙医医院，是目前国际上规模最大的三级甲等蒙医综合医院，是我国首家以蒙医药医疗为主的集医疗、科研、教学、预防、保健、康复、急救、制剂为一体的现代化蒙医综合医院。蒙医特色专科技术及应用于临床的300余种院内制剂在治疗心血管、脑血管、血液病、骨折、颈椎病、腰椎间盘突出症、风湿性关节炎、各类皮肤病、抑郁症、肿瘤等疑难疾病方面疗效显着。
第四名：内蒙古医科大学第二附属医院
内蒙古医学院第二附属医院，是自治区乃至华北地区较有影响的一所集医疗、急救、预防、教学、科研为一体的大专科、小综合现代化医院，是自治区唯一的一所三级甲等骨科医院。骨科被评为自治区领先学科，是国务院指定的有硕士学位授予权的骨科硕士生培养基地。在颈椎病、严重脊柱侧弯、脊柱损伤、断肢（指）再造、小儿先天性髋关节脱位及骨肿瘤等疾病的治疗方面已达或接近国内、国际先进水平。
第五名：内蒙古自治区中医医院
内蒙古自治区中医医院，现已发展成为内蒙古地区唯一一所集医疗、教学、科研、康复、保健、制剂、养生于一体的自治区级三级甲等综合性中医医院。医院设有临床科室45个，医技科室9个，病区26个。其中，国家卫生健康委临床重点专科2个，国家中医药管理局重点学科2个，现有1.5T核磁、双板DR、移动DR、高档动脉血管检查彩超、血液透析机、动静态平衡检测评估训练系统等大型先进医疗设备及中医特色诊疗设备。
第六名：内蒙古自治区肿瘤医院
内蒙古自治区肿瘤医院，是一所集医疗、教学、科研、康复、防癌保健为一体的三级甲等肿瘤专科医院。医院为突显肿瘤专科特色，统筹学科发展布局，医院确定肿瘤内科、放疗科、微创介入科、影像科、病理科为医院的重点学科，腹部肿瘤外科等科室为重点建设学科，初步实现了肿瘤的规范化、精准化、个性化诊疗，肿瘤患者收治能力不断提高。
第七名：内蒙古自治区妇幼保健院
内蒙古自治区妇幼保健院，是自治区首家集妇女儿童保健、医疗、科研、教学、培训于一体的三级甲等妇幼保健院、三级甲等儿童医院、三级甲等妇产医院。特色科室有产科、新生儿科、儿内科、儿外科、儿童保健科、妇科、生殖医学科、遗传优生科、妇女保健科、内科等。在救治羊水栓塞、多胎妊娠、凶险性前置胎盘等危急重症以及极低出生体重儿和新生儿呼吸管理方面积累了丰富的理论和临床经验。
第八名：呼和浩特市蒙医中医医院
呼和浩特市蒙医中医医院，是一所以蒙医、中医为主的综合性医疗机构。拥有国家重点专科1个（蒙医五疗科），自治区重点专科5个（脾胃科、针灸科、脑病科、心病科、蒙医针灸推拿科），配置有1.5T核磁、64排螺旋CT、血管造影机等大型先进诊疗设备及蒙中医特色治疗设备。
第九名：呼和浩特市第二医院
呼和浩特市第二医院，是一所集医、教、研为一体，由中华人民共和国卫生部授予的三级甲等传染病专科医院。主要诊治各型肝炎、肝硬化、肝腹水以及呼吸系统、消化系统、神经系统等各种常见疑难传染性疾病，并采用中西医结合治疗技术、人工肝支持治疗技术、腹水浓缩回输技术及腔镜下介入治疗技术，救治了许多重症肝病患者。
第十名：呼和浩特市妇幼保健院
呼和浩特市妇幼保健院，是一所以“大妇幼、强综合、大健康”为业务定位方向，以”保健和医疗”为主体、“科研和教学”为两翼为妇女儿童提供全方位全生命周期服务的三级甲等妇幼保健机构。学科齐全，特色突出，重点打造妇科、产科、儿科、新生儿科、中医妇科、中医儿科五大临床重点专科，新生儿科、儿童保健科两大学科，在新生儿疾病筛查、中医妇科、中医儿童保健、儿童早期发展、母婴产后康复服务等方面极具区域特色优势。