细菌性痢疾建议就诊于消化内科，南京治疗细菌性痢疾医院排名靠前的是南京医科大学第一附属医院消化内科、南京鼓楼医院消化内科、东南大学附属中大医院消化内科。南京医科大学第一附属医院消化内科是国家重点临床专科，全国排名靠前，疑难病诊疗能力突出；南京鼓楼医院消化内科是全国老牌强科，内镜领域影响力深远；东南大学附属中大医院消化内科是省临床重点专科，内镜技术达国内先进水平。
1、南京医科大学第一附属医院 消化内科
南京医科大学第一附属医院消化内科是卫健委国家重点临床专科、教育部国家重点学科培育点，拥有博硕士学位授予点及博士后流动站。2019年中国医科院科技量值全国专科排行第8，设7个亚专科，自主研发多项专利技术，在消化道早癌、瘘口封堵等领域特色鲜明，承担多项国家自然科学基金，获多项国家级、省级科技奖项，为全省消化科疑难病“托底”。
2、南京鼓楼医院 消化内科
南京鼓楼医院消化内科是国家临床重点专科，2020年复旦版全国消化病专科声誉排行第15名，为江苏唯一入围科室。作为全国最早内镜中心之一，创办《中华消化内镜杂志》，亚专科布局完善，特色内镜技术国内领先。学科带头人邹晓平、王雷教授造诣深厚，承担多项国家级课题，获国家科技进步二等奖等多项荣誉，医教研实力雄厚。
3、东南大学附属中大医院 消化内科
东南大学附属中大医院消化内科是江苏省规模最大的省级临床重点专科，中国消化内镜学院培训基地。内镜设备国内领先，在食管和胃早癌ESD治疗、贲门失弛缓症POEM治疗等领域居国内领先地位，常规开展各类高端内镜微创技术。多次承办国家级学术会议，承担多项国家、省市级课题，获省市级科技进步奖，培训消化内镜人才近万人次。
4、东部战区总医院 消化内科
东部战区总医院消化内科拥有60多年历史，是南京军区消化病中心、全国及全军临床药理基地，南京大学博硕士培养点及博士后流动站。内镜诊疗技术达国内先进水平，早期开展ESD等微创技术，在消化道肿瘤早期诊治、肝硬化并发症治疗方面经验丰富。聚焦消化道肿瘤、溃疡性结肠炎研究，获多项省部级课题、科研成果及国家发明专利。
5、南京市第一医院 消化内科
南京市第一医院消化内科是江苏省及南京市临床重点专科、南京医科大学硕士点。是国家消化病临床研究中心协同分中心、幽门螺杆菌规范化诊治全国示范中心，内镜诊疗项目齐全。承担多项国家、省市级科研项目，获省卫健委新技术引进奖等荣誉，在早期消化道肿瘤筛查、HP精准治疗、炎症性肠病诊治方面特色突出。
