合肥呼吸内科医院排名靠前的是安徽医科大学第一附属医院呼吸内科、安徽省立医院呼吸内科、安徽医科大学第二附属医院呼吸内科等，安徽医科大学第一附属医院呼吸内科是卫计委国家临床重点专科建设项目、安徽省呼吸病学主任委员所在地；安徽省立医院呼吸内科是国家呼吸与危重症医学科规范化建设优秀单位、安徽省呼吸专科联盟牵头单位，可提供呼吸系统全方位诊疗服务，覆盖肺癌早诊早治与晚期精准诊疗、呼吸内镜介入、疑难罕见病诊疗等领域；安徽医科大学第二附属医院呼吸内科是安徽省临床医学研究中心（呼吸与危重症医学）、安徽省“十三五”重点专科，下设肺部感染、肺癌与呼吸介入、呼吸危重症等亚专科。
1、安徽医科大学第一附属医院 呼吸内科
该科室是卫计委国家临床重点专科建设项目、安徽省教育厅重点学科，安徽省呼吸病学主任委员所在地，为国家药物临床试验基地、老年医学硕士及博士学位授权点。拥有独立的支气管镜室、内科胸腔镜室、多导睡眠监测室和省级实验室，配备多台有创、无创呼吸机及监护仪。常规开展电子支气管镜、CT引导下经皮肺穿刺等诊疗技术，近年拓展肺癌射频消融、经支气管镜介入治疗等新项目，对肺癌、慢阻肺、呼吸衰竭等疾病诊疗经验丰富。先后主持中荷国际合作项目、国家自然科学基金等数十项课题，参与国家“973”项目，近年发表论文200余篇，其中SCI论文60篇。
2、安徽省立医院 呼吸内科
该科室重建于1988年，是国家呼吸与危重症医学科规范化建设优秀单位、中国呼吸罕见病联盟创始单位、安徽省卫生医疗重点专科，为国家卫健委肺癌诊断与治疗示范基地、国家药物临床试验基地，也是安徽省呼吸专科联盟、安徽省呼吸罕见病专科联盟牵头单位，是中国科学技术大学等多所医学院校的博、硕士培养点。可提供呼吸系统全方位诊疗服务，覆盖肺癌早诊早治与晚期精准诊疗、呼吸内镜介入、疑难罕见病诊疗等领域。近年承担国家自然科学基金、国家十三五精准医学项目等多项课题，曾获安徽省科技进步奖一等奖等省部级荣誉。
3、安徽医科大学第二附属医院 呼吸内科
该科室是安徽省临床医学研究中心（呼吸与危重症医学）、安徽省“十三五”重点专科，为国家食品药品监管局认定的药物临床研究机构，是安徽医科大学呼吸内科学、老年医学硕、博士点，也是安徽省呼吸内科住院医师、全科医师规范化培训基地。下设肺部感染、肺癌与呼吸介入、呼吸危重症等亚专科，RICU开设22张床位含1间负压病房，配备多种品牌呼吸机、经鼻高流量氧疗仪等设备，开展无痛超声支气管镜、经皮肺穿刺消融等技术。
4、合肥市第一人民医院 呼吸内科
该科室为安徽省“十二五”临床重点培育专科、合肥市临床重点专科，是合肥市医学会呼吸病学分会主委单位、合肥市呼吸内科质控中心主任单位，为国家级全科医师及住院医师规范化培训基地，2019年通过PCCM认证，2020年建成合肥市呼吸系统疾病临床医学研究中心。拥有睡眠呼吸中心、肺功能检查室、支气管镜诊疗室和RICU，配备超声支气管镜、电子胸腔镜等设备。主攻慢阻肺、呼吸衰竭及危重症、睡眠呼吸暂停、肺癌等疾病诊治，无创通气应用、慢性气道疾病和睡眠呼吸障碍诊疗处于国内先进、省内领先水平，抗疫期间新冠肺炎治愈率100%，率先完成合肥定点医院清零任务。
5、合肥市第二人民医院 呼吸内科
该科室是合肥市第七周期临床重点培育专科，为安徽医科大学、蚌埠医学院等多所医学院校硕士研究生培养点，是国家住院医师规范化培训基地、国家PCCM科介入呼吸病学及呼吸康复进修基地，也是国家呼吸临床研究中心-中日医院呼吸专科医联体及慢阻肺协作组成员单位。学科开放床位182张，设四个病区及RICU病房，分设感染、呼吸慢病与康复、呼吸危重症、胸部肿瘤与介入呼吸病学四个亚专科，开设肺癌与肺结节、呼吸睡眠等多个专病门诊。常规开展俯卧位通气、重症血液净化、呼吸介入诊疗、经皮肺穿刺消融等特色技术，覆盖呼吸危重症、复杂感染等多领域诊疗需求。
