治疗先天性心脏病建议就诊于心内科，北京市治疗先天性心脏病排名靠前的医院分别为首都医科大学附属北京儿童医院心内科、首都医科大学附属北京安贞医院小儿心脏中心内科、中国医学科学院阜外医院小儿内科，首都医科大学附属北京儿童医院心内科收治患儿数量居全国首位，微创介入治疗水平达国内外儿科领先；首都医科大学附属北京安贞医院小儿心脏中心内科是国内现代化专业标杆，先心病介入与镶嵌手术实力强劲；中国医学科学院阜外医院小儿内科汇聚资深医师，在小儿疑难心血管病诊治上优势显著。
1、首都医科大学附属北京儿童医院 心内科
该科室收治各类小儿心脏内科疾病患儿数量居全国首位，配备先进三维标测系统，开展的小儿心律失常射频消融手术成功率超95%，部分手术可实现零X线曝光，处于国内外儿科领先水平。开设先心病介入微创专病门诊，近30年完成数千例介入微创手术，微创治疗涵盖多种先心病，创伤小、恢复快，建立完善的患儿术前指导与术后随访体系，诊疗效果与口碑俱佳。
2、首都医科大学附属北京安贞医院 小儿心脏中心内科
该科室是国内首个采用国际先进内外科结合模式的儿童心血管病科室，为首都医科大学博硕士培养基地、首批先心病介入治疗培训基地。先心病介入治疗与复杂先心病内外科镶嵌手术水平居全国前列，开通先心病产前-生后诊治绿色通道，承担多项国家级、市级科研项目，斩获多项科技奖励，在儿童心肌病诊疗与研究方面成果突出。
3、中国医学科学院阜外医院 小儿内科
该科室汇聚一批临床经验深厚的高职称医务人员，诊疗范围覆盖小儿内科常见病、多发病及疑难病。尤其在小儿泌尿系统、消化系统、呼吸系统疾病诊治基础上，聚焦小儿风湿性心脏病、先天性心脏病、心肌炎等心血管疾病，凭借扎实的临床功底与严谨的诊疗理念，为患儿提供精准诊疗服务，在小儿心血管疑难病症处置上形成鲜明优势，行业认可度高。
4、北京大学第一医院 小儿心内科
该科室深耕小儿心血管疾病基础与临床研究，在国内外率先发现硫化氢为心血管功能调节新型气体信号分子。创建全国首家儿童晕厥专科门诊与诊治协作网络，建立大型晕厥患儿数据库，发布相关诊断标准与治疗方案，研究成果推广至全国，斩获教育部科技进步一等奖、宋庆龄儿科医学奖，显著提升我国儿童晕厥诊治水平。
5、首都儿科研究所附属儿童医院 心血管内科
该科室为医院重点发展学科，集医疗、教学、科研、预防于一体，开设高血压、晕厥专病门诊。在小儿心肌炎、先天性心脏病、川崎病、心律失常、心力衰竭等疾病无创治疗上达国内先进水平，尤其擅长危重川崎病诊治与心衰全面管理，开展先心病介入、射频消融等项目。承担多项国家级、市级科研项目，发表大量核心及SCI论文，教学与科研实力同步提升。
