江西肺科比较好的医院是南昌大学第一附属医院、南昌大学第二附属医院、赣州市人民医院，肺科一般是指呼吸科，南昌大学第一附属医院呼吸科是江西省唯一一家拥有卫生部国家内镜培训基地，是江西省呼吸疾病研究所，具有丰富的临床经验。南昌大学第二附属医院呼吸内科是江西省最早成立的呼吸学科专业科室，赣州市人民医院呼吸与危重症医学科是赣南最早的呼吸内科专科。
第一名：南昌大学第一附属医院-呼吸科
南昌大学第一附属医院呼吸科是江西省唯一一家拥有卫生部国家内镜培训基地，江西省呼吸疾病研究所，江西省重点实验室。对慢性阻塞性肺疾病，支气管哮喘，肺癌，肺栓塞，各种肺部感染性疾病：包括重症肺炎、免疫抑制合并肺部感染，胸膜疾病、甲型H1N1流感、慢性咳嗽的诊治、大咯血、呼吸衰竭的救治及各种呼吸系统疑难少见病包括：间质性肺疾病，系统性血管炎，肺泡蛋白沉积症、肺出血肾炎综合症等的诊治方面具有丰富的经验。
第二名：南昌大学第二附属医院-呼吸内科
南昌大学第二附属医院呼吸内科是江西省最早成立的呼吸学科专业科室、江西省呼吸专业最早硕士学位授予点。在急性呼吸窘迫综合征（ARDS）、慢性阻塞性肺疾病（COPD）、支气管哮喘、肺癌、感染性肺疾病等的诊治方面积累了一系列丰富的临床经验。尤其在机械通气、危重病人的抢救和肺癌的治疗方面更具优势。
第三名：赣州市人民医院-呼吸与危重症医学科
赣州市人民医院呼吸与危重症医学科是赣南最早的呼吸内科专科，是全省第一批省市医学呼吸专业共建先进学科，被赣州市卫健委评为赣州市第一、第二、第三周期呼吸内科专业医学领先学科。在重症哮喘、肺间质疾病、肺癌、胸腔积液、重症肺炎、急慢呼吸衰竭、肺栓塞等疾病诊治方面，积累了丰富的临床经验。
第四名：江西省人民医院-呼吸与危重症医学科
江西省人民医院呼吸与危重症医学科是江西省成立最早的呼吸学科专业科室，是江西省人民医院重点学科。医疗方面接受大量常见病及疑难危重病人的救治。主要病种有，慢性阻塞状肺疾病（COPD）肺部感染（尤其是真菌感染），哮喘，肺癌，弥漫性肺间质性疾病，胸腔积液，呼吸衰竭，肺血管病，呼吸疑难杂症，不明原因发热等疾病。
第五名：赣南医学院第一附属医院-呼吸内科
赣南医学院第一附属医院呼吸内科对肺炎、慢性支气管炎、肺气肿、肺心病、支气管哮喘等经具有较丰富的临床诊治经验；能熟练救治呼吸衰竭、大咯血、重症哮喘等危重病。并开展了电子支气管镜检查术、支气管肺泡灌洗术、经支气管镜肺组织活检术、胸膜活检术等。
第六名：井冈山大学附属医院-呼吸内科
井冈山大学附属医院呼吸内科为集医疗、教学、科研为一体的特色科室。对呼吸系统常见病及多发病的诊治有丰富的经验，疑难重症及罕见病诊治及机械通气等方面特色鲜明。拥有熟练的呼吸内镜技术，常规开展电子支气管镜组织活检、肺泡灌洗、刷检等技术，并逐步开展气管镜介入治疗。
第七名：宜春市人民医院-呼吸内科
宜春市人民医院呼吸内科是宜春市技术力量最强、设备最完善的呼吸与呼吸危重症疾病诊疗中心，宜春市医学领先学科，是南昌大学第一附属医院肺癌诊疗中心附属谢绍华工作组，被全国基层肺癌诊疗能力提升项目组授予肺癌诊断与治疗示范中心。在赣西地区率先开展经支气管肺活检（TBLB）和经支气管针吸淋巴结活检（TBNA）技术，大大提高了肺部疾病的确诊率。
第八名：江西省中西医结合医院-呼吸内科
江西省中西医结合医院呼吸内科是省级重点中西医结合专科，擅长于纤支镜诊查术、肺泡灌洗术、经纤支镜肺活检、经皮肺穿刺、胸膜活检、胸腔闭式引流、机械通气等诊疗技术。中西医结合治疗支气管哮喘、慢性支气管炎、慢性阻塞性肺疾病、肺源性心脏病、肺癌、顽固性咳嗽等方面达江西省内先进水平。
第九名：南昌大学第四附属医院-呼吸内科
南昌大学第四附属医院呼吸内科以医院的整体设施为平台，充分利用医院影像中心、细菌室、病理科等科室的条件，紧密结合临床，围绕支气管哮喘、慢性阻塞性肺疾病（COPD）、呼吸衰竭、肺部感染、慢性咳嗽、肺癌、胸膜疾病、肺栓塞、肺间质性疾病及睡眠呼吸障碍性疾病的发病机制与防治等开展了大量的临床，教学，科研工作，并取得了显著的成绩。
