岳阳市二人民医院擅长骨科、神经外科、儿科、肿瘤科、康复科。上述科室学科综合实力领先，临床专科诊治优势突出，能够为患者提供优质的医疗服务。
1、骨科
岳阳市二人民医院骨科，包括骨一科、骨二科。骨一科是以手外科、显微外科、上肢创伤及血管外科为主的骨科省级重点专科。现开展了各类复杂手外伤的显微修复，复杂断指再植、外科介入治上肢创伤、多种先天畸形矫正、拇手指缺损再植、功能重建等手术。骨二科专注下肢骨关节损伤，在下肢骨关节损伤、骨盆髋臼损伤等方面均累积了丰富的临床经验。
2、神经外科
岳阳市二人民医院神经外科，是岳阳巿首批临床重点学科。拥有德国蔡司手术显微镜、德国艾克曼脑室镜、无创颅内压监护仪、美国强生显微手术器械、振动排痰仪等一大批先进设备，另外还有心电监护仪、心电图机、输液泵及其他危重急症患者抢救设备。在神经外科显微手术、脑室镜微创手术、颅底外科手术、脑血管病介入手术等方面成绩斐然。
3、儿科
岳阳市二人民医院儿科，包括儿科一病区、儿科二病区，是岳阳市市级重点学科。在岳阳市率先开展脓毒血症、重度中毒、严重颅内感染等危重病人的救治工作。2013年开始开展生长发育特色专科为儿童矮身材、肥胖、性早熟等疾病提供医学支持。2016年起引入儿童视频脑电图、儿童电子胃镜，已累积为上千人次开展检查、治疗。
4、肿瘤科
岳阳市二人民医院肿瘤科，是岳阳市开展最早的专科之一，也是岳阳市最早的重点专科。能开展各种恶性肿瘤MDT、放化疗、靶向治疗、免疫治疗、介入治疗、HIFU、氩氦刀治疗等，介入治疗方面目前已开展粒子植入、肿瘤微波消融、肝癌栓塞灌注化疗等，拥有岳阳地区首台PET-CT、3.0核磁共振、医科达Precise型全数字医用直线加速器等设备。
5、康复科
岳阳市二人民医院康复科，是湖南省地市级康复科省级重点专科。现代化的康复治疗设备有高、中、低频治疗仪，气囊式体外反搏，威伐光，冲击波治疗仪，紫外线治疗仪，磁疗仪，减重步态训练器，电动起立床，颈椎、腰椎牵引床及系列康复训练设备等。主要收治的病种包括：骨关节系统疾病、神经系统疾病、内科疾病康复、脑瘫等。
