生殖科医院全国排名第一的是北京大学第三医院，该院的生殖医学中心是中国大陆第一例试管婴儿诞生地，也是该学科在整个国际上规模最大、技术最全的研究中心，并完成了世界首例MALBAC婴儿的诞生。此外，生殖科比较好的还有复旦大学附属妇产科医院的集爱遗传与不育诊疗中心，以及山东大学附属生殖医院，均已建立完善的诊疗系统。
第一名：北京大学第三医院-生殖医学中心
北京大学第三医院的生殖医学中心是中国大陆第一例试管婴儿诞生地，集医、教、研为一体，是世界上诊疗规模最大、技术最全面的生殖健康研究中心。该科室为国内首批生殖医学临床培训基地，先后诞生了我国大陆首例和第二例试管婴儿、首例赠卵试管婴儿、首例冻融胚胎试管婴儿及世界第二例、国内首例“三冻”试管婴儿等。国际首创胚胎植入前遗传学诊断新方法MARSALA，完成“单基因检测、染色体鉴定及连锁分析”三重诊断，诞生了世界上首例MALBAC婴儿。
第二名：复旦大学附属妇产科医院-集爱遗传与不育诊疗中心
复旦大学附属妇产科医院的集爱遗传与不育诊疗中心，为上海市临床医学诊疗中心之一。中心有完善的门诊－病房－内分泌检测实验室的诊疗系统，诊疗范围包括女性全生命周期各阶段的生殖内分泌失调引起的各类问题或疾病，包括妇科内分泌经典疾病、各种原因不育症、围绝经综合征、性分化及发育异常等。
第三名：山东大学附属生殖医院-生殖中心
山东大学附属生殖医院是山东大学直属附属医院，山东大学博、硕士点和博士后流动站，2019年获批三级甲等生殖健康与不孕症专科医院，临床诊疗规模位居全国前三位，辅助生殖技术和生殖医学科研具国际领先水平。医院具有多个国家级、省部级临床科研平台，包括国家辅助生殖与优生工程技术研究中心、国家妇产疾病临床医学研究中心山东省分中心、生殖内分泌教育部重点实验室、山东省生殖健康临床医学研究中心、山东省生殖健康技术创新中心和人类辅助生殖技术及人类精子库培训基地。
第四名：郑州大学第一附属医院-生殖医学中心
郑州大学第一附属医院生殖医学中心现已建设成为以生殖医学和遗传学为核心、辅助生殖技术和优生优育为医疗特色的大型综合诊疗中心。国内首批通过ISO9001国际认证的生殖专科医院，2019年国际首例肥厚型心肌病胚胎植入前遗传学诊断阻断致病基因子代遗传“健康心宝宝”分娩。每年进行试管婴儿取卵周期10000余例，截止2019年12月已出生健康婴儿5万余名，是全国年服务量最多的医院之一，为来自国内外的不孕不育和遗传病夫妇解除了痛苦。
第五名：中信湘雅生殖与遗传专科医院-生殖中心
中信湘雅生殖与遗传专科医院生殖中心，是目前国内建筑面积最大的单体生殖中心，是集医疗与科研为一体的大型生殖中心，其治疗量是国际IVF-ET及衍生技术周期数最多的生殖中心之一，是医院的重点科室。中心全面开展IVF-ET及其衍生技术，目前已完成新鲜胚胎取卵周期30万余例，试管婴儿鲜胚移植平均妊娠率达65%，冻胚移植平均妊娠率达60%。患者遍布全球19个国家和地区，其中40%患者来自省外。
第六名：中山大学附属第一医院-生殖医学中心
中山大学附属第一医院生殖医学中心已经建立了完善的人类辅助生殖技术体系，是我国首批获得卫生部人类辅助生殖技术准入的单位，同时该专科也是广东省医学重点和特色专科，是广东省生殖医学重点实验室依托单位。近年来，该专科拓展了特色技术——植入前遗传学诊断技术的应用范围，目前可进行α和β地中海贫血、染色体易位、进行性肌营养不良和脊肌萎缩症等多种疾病的诊断，成功应用于胚胎的HLA配型。
第七名：南京鼓楼医院-生殖医学中心
南京鼓楼医院生殖医学中心是江苏省妇幼保健重点专科，江苏省“十二五科教兴卫工程”生殖医学创新团队，国家卫生部首批批准开展人类辅助生殖技术5家单位之一。常规开展宫腔内人工授精技术（IUI）、配子与胚胎冻融技术、胚胎种植前遗传学诊断技术（PGD）、卵子赠送技术、未成熟卵体外成熟培养技术（IVM）等一系列辅助生殖技术。
第八名：四川大学华西第二医院-生殖内分泌/计划生育科
四川大学华西第二医院生殖内分泌科/计划生育科，为国家卫生健康委能力建设和继续教育中心妇科内分泌诊疗体系建设及健康教育研究中心三大培训中心之一。目前已成为西部地区规模最大的妇产科亚专业之一，开设了生殖内分泌门诊、不孕症门诊等，主要承担妇科内分泌疾病和不孕症的相关诊断和治疗，并开展各类计划生育相关工作。
第九名：重庆市妇幼保健院-生殖与遗传研究所
重庆市妇幼保健院生殖与遗传研究所复旦专科排行榜排名第7，包括胚胎实验室、分子遗传实验室、高通量测序实验室、细胞生物学实验室等4个科研平台。主要从事基础研究，如代谢组学对早期胚胎发育的调控机制、改善高龄卵子的方法及机制探索等，以及人工智能技术应用于人类早期胚胎发育质量评估的临床转化研究、人类辅助生殖实验室自动化设备的研制等。
第十名：华中科技大学同济医学院附属同济医院-生殖医学中心
华中科技大学同济医学院附属同济医院的生殖医学中心，现有2个病区。科室共有5位教授在中华医学会生殖医学分会历任常委、委员及青委，1位教授在中国医疗保健国际交流促进会生殖医学分会任副主任委员，2位教授在世界中联生殖医学专业委员会任副会长及理事，6位教授在湖北省医学会生殖医学分会历任主任委员、常委及委员。科室尤其擅长于治疗不孕症、输卵管梗阻、子宫内膜异位症、子宫肌瘤、卵巢早衰、卵巢过度刺激综合征、多胎妊娠等疾病。
