滁州三甲医院有两家，分别是滁州市第一人民医院和滁州市中西医结合医院。滁州市第一人民医院是皖东地区规模最大、综合实力最强的三级甲等综合性医院；滁州市中西医结合医院是全国重点中西医结合医院，也是安徽省唯一一所三级甲等中西医结合医院。
第一名：滁州市第一人民医院
滁州市第一人民医院是皖东地区规模最大、综合实力最强的三级甲等综合性医院，承担临床医疗、医学教育、医学科研、预防保健等任务。医院拥有“十四五”省级重点专科6个、市级重点专科10个，先后荣获“安徽省青年文明号”、第十二届安徽省文明单位”等多项荣誉称号，医院综合实力不断增强，区域影响力不断扩大。
第二名：滁州市中西医结合医院
滁州市中西医结合医院是全国重点中西医结合医院、全国重点地市级中医院、全国中医药文化宣传教育基地等，同时也是安徽省唯一一所三级甲等中西医结合医院。拥有省级中医重点专科、省级（临床）重点专科、省级中医优势特色专科等，先后荣获国家中医药文化宣传教育基地、省级文明单位、省中医名院建设单位等多项称号。
第三名：天长市人民医院
天长市人民医院始建于1949年2月，是一家融医疗、教学、科研为一体的综合性三级医院。医院拥有一批进口及先进设备。现有心内科、肾内科两个安徽省重点特色专科，新生儿科、骨科、普外科具有专科优势，可开展全科医疗、诊治各种内、外、妇、儿、中医、传染等科疑难病症与常见病。
第四名：全椒县人民医院
全椒县人民医院是集医疗、急救、预防保健、康复、教学科研于一体的三级综合医院和爱婴医院，是蚌埠医学院、滁州城市职业学院等多家院校的教学医院，是滁州市一院紧密型医联体单位。医院内心血管内科、康复科为市级重点学科，骨科为市级重点培育学科。肿瘤内科、肿瘤放疗科、呼吸内科、康复科、妇科、体检中心、医美中心、消化内科等为特色科室。能开展较高水平的专业技术项目200多种。
第五名：明光市人民医院
明光市人民医院始建于1950年，目前是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、急救、康复为一体的现代化三级综合性医院，国际爱婴医院。现已形成了心脏外科、微创外科、腔镜手术、心血管疾病治疗、妇科盆底功能障碍疾病、消化内镜下诊疗、各类介入治疗等为特色品牌的全新技术格局，多项技术在本地区乃至全省处于领先水平。创伤中心成为安徽省首批创伤中心、国家创伤联盟建设单位。
第六名：明光市中医院
明光市中医院成立于1984年，是一所以中医和中西医结合为特色的国家三级中医院、爱婴医院和省示范中医院，国家卫健委重点扶持县级中医院。医院中针灸推拿科、骨伤科、脑病科、肝病为安徽省重点中医专科、专病。2019年2月，医院牵头全市基层医疗机构成功创成“全国基层中医药先进单位”。
第七名：天长市中医院
天长市中医院座落于天长市区的中心位置，是一所集医、教、研于一体、服务功能健全的全国示范中医院、三级中医院。医院骨伤科、肿瘤科、肛肠科和脾胃病专病是省级重点专科，脾胃病同时也是国家级重点专科，针灸理疗康复科是省级特色专科，糖尿病专科是国家中医药公共卫生项目-重大疑难疾病(糖尿病)临床防治分中心，肾病科、儿科是滁州市重点专科。病理开展了术中快速病理、TCT等新项目在全市领先。