北京中医排名第一的医院是中国中医科学院西苑医院，该医院是新中国成立后由中央人民政府建设的第一所大型中医医院，是全国中医血液病、老年病、心血管病专科医疗中心，国际针灸和中医药学历教育的教学基地。除此以外，北京中医好的医院还有中国中医科学院广安门医院、中国中医科学院广安门医院南区，是全国示范中医医院及中医文化建设重点单位。
1、中国中医科学院西苑医院
该医院是一所大型综合性三级甲等中医医院，是全国示范中医医院，也是国际针灸和中医药学历教育的教学基地。拥有中国科学院院士陈可冀、中国工程院院士周霭祥，在治疗心脑血管疾病、血液病、胃肠疾病与肝病等方面具有较好的疗效，并在国内外享有盛誉。
2、中国中医科学院广安门医院
该医院集医疗、教学、科研和预防保健为一体，是一所三级甲等中医医院，是中央干部保健基地，也是世界卫生组织传统医学合作中心组成单位、首批国家中医药服务出口基地之一。以中药、针灸、推拿、康复等中医传统治疗方法为主，辅以现代化诊疗手段，在疾病治疗方面有丰富的经验和独特的疗效。
3、中国中医科学院广安门医院南区
该医院是大兴区唯一一所综合性三级甲等中医医院，具备一定的中医优势特色和医、教、研、防综合服务能力，是全国中医医院中医文化建设重点建设单位。设有肿瘤科、肾病科等科室，积极发挥中医药特色和优势，为广大患者提供优势明显、疗效突出的诊疗服务。
4、首都医科大学附属北京中医医院
该医院是北京市唯一的一所市属综合性、现代化三级甲等中医医院。拥有国医大师、国家级名老中医等专业人才。拥有赵炳南皮肤病研究中心、脾胃病中心等临床诊疗中心。设有包括肝炎、风湿病、银屑病等多个中医专台，对多种疾病的中医诊疗水平居国内外领先。科室连续十年获首都精神文明单位。
5、北京中医药大学东直门医院
该医院是国家“211工程”、“985工程”优势学科创新平台“，是首批国家大型综合性三级甲等中医医院和国家示范中医医院，是世界卫生组织中医适宜技术项目培训基地。医院在中医临床科研前沿创造了突出业绩，在业界享有盛誉。