安徽省儿科比较好的医院是安徽省儿童医院、安徽医科大学第一附属医院、安徽省立医院，安徽省儿童医院是国家发展改革委、国家卫生健康委批准的第一批国家区域医疗中心试点单位，先后获得“全国卫生系统先进集体”“全国巾帼文明示范岗”等称号。安徽医科大学第一附属医院儿科是安徽省临床医学重点学科，安徽省立医院儿科是安徽省医学会儿科学分会主任委员单位。
第一名：安徽省儿童医院
安徽省儿童医院是国家发展改革委、国家卫生健康委批准的第一批国家区域医疗中心试点单位，由省人民政府和复旦大学附属儿科医院，依托安徽省儿童医院合作共建，为政府举办的公益性医疗机构。先后获得“全国卫生系统先进集体”“全国巾帼文明示范岗”“省直文明单位”“全国院务公开先进单位”“合肥市消防安全能力建设4A级单位”“全国创先争优先进集体”“全国卫生计生系统先进集体”等各种荣誉称号。在“安徽省十大服务行业居民满意度调查”中，2014-2018年连续五年获得“金口碑奖”。
第二名：安徽医科大学第一附属医院-儿科
安徽医科大学第一附属医院儿科为住院医师规范化培训国家重点专业基地，安徽省危重新生儿转运救治中心，安徽省临床医学重点学科。常规开展无痛胃镜、胃肠电生理、肾脏穿刺病理活检、肺功能、新生儿中心静脉置管、新生儿换血、神经电生理检查、遗传代谢病筛查、儿童高级生命支持等临床诊疗项目。始终保持中国医院科技量值排行榜（儿科学）、复旦医院排行榜（儿科学）、儿内科专家国际学术影响力排名全国百强，安徽第一的领先位置。
第三名：安徽省立医院-儿科
安徽省立医院儿科是集医疗、科研、教学于一体的儿科医学基地，是安徽省医学会儿科学分会主任委员单位、安徽医科大学博士研究生培养点及硕士研究生培养点。科室现有8个住院病区：总院5个，南区2个，西区1个，床位共有350余张，其中小儿呼吸、血液、新生儿、危重症医学等水平处于全省领先水平，部分技术处于国内先进水平。2019年科室门诊量达54.36万人次，年收治住院病人1.7万余人。
第四名：蚌埠市蚌埠医学院第一附属医院-儿科
蚌埠市蚌埠医学院第一附属医院儿科，逐步发展成省内极具影响力的三甲医院综合儿科。目前拥有新生儿危重症监护中心、儿童危重症监护中心、儿童呼吸、儿童血液肿瘤、儿童神经康复、儿童内分泌遗传代谢病、儿童风湿肾病等多个亚专业。近3年获批各级各类科学研究课题32项，其中国家级1项，省级8项；获批教学课题11项，其中省级3项，校级8项；获批国家级大学生创新创业项目2项。
第五名：安徽医科大学第二附属医院-儿科
安徽医科大学第二附属医院儿科是安徽省“十二五”临床重点培育专科、安徽医科大学第二附属医院重点学科。设有血液、内分泌、心血管、新生儿、儿童重症（NICU+PICU）、呼吸、消化、肾脏、神经及风湿免疫等临床亚专业，其中儿童血液专业、儿童内分泌在省内儿科学界处于领先地位。
第六名：合肥市第一人民医院-儿科
合肥市第一人民医院儿科2006年被授予安徽医科大学儿科硕士研究生培养点；2007年被批准为安徽省NICU专科护士培训基地；2010年被批准为合肥市重点扶持学科。主持和参与省、市级科研项目共9项，主持市级重大科研项目4项。2013年成功救治体重850克的三胞胎、四胞胎，新生儿危重症救治水平达省内先进；2014年省内首次应用美国FDA认证OLYMPICCOOLCAP，治疗新生儿缺氧缺血脑病。
第七名：合肥市第二人民医院-儿科
合肥市第二人民医院儿科目前拥有多个亚专业组。包括新生儿专业、儿童消化专业、儿童血液专业、儿童内分泌专业、儿童重症专业等，其中新生儿专业为合肥市危重新生儿救治中心。儿童呼吸专业为中国科学技术大学附属第一院（安徽省立医院）“儿科哮喘与结核病专科联盟”单位，获批“儿童哮喘标准化门诊”。
第八名：阜阳市人民医院-儿科
阜阳市人民医院儿科多年来承担阜阳市儿科疑难、危重症的救治及下级医院转诊工作。儿科目前分为新生儿病区、PICU病区、儿科一病区、儿科二病区、儿科三病区、小儿外科及门急诊病区。承担了阜阳全市及周边省市各种疾病的转诊及收治工作。在小儿呼吸、血液、消化、内分泌、神经、心血管、肾脏、风湿免疫性疾病的诊治具有较高的水平。其中小儿内分泌是阜阳市成立最早的专科，对矮小症、性早熟、糖尿病等诊治始终走在全市前列。
第九名：合肥市滨湖医院-儿科
合肥市滨湖医院儿科是全国新生儿神经重症监护培训基地，合肥市重点扶持学科，长期与国内外顶尖医院交流合作，掌握了先进的国内外临床诊疗技术。设有小儿重症、小儿呼吸、小儿消化、小儿内分泌、小儿神经、小儿肾脏及儿童发育行为等亚专业，新生儿危重症及超早产儿救治水平达到省内先进。
第十名：蚌埠医学院第二附属医院-儿科
蚌埠医学院第二附属医院儿科设置了儿科门诊、急诊、儿科普通病房和新生儿监护中心等，拥有先进的诊疗设备。近年来，儿科先后开设矮小症专科门诊、儿童多动症专科门诊，儿童雾化治疗中心等一系列特色专科门诊。成功地开展了气管插管技术、机械通气技术、周围静脉高营养技术、PICC穿刺术、静脉留置针、肺表面活性物质的应用等技术。