昆明肝胆外科医院排名比较靠前的是昆明医科大学第一附属医院、昆明医科大学第二附属医院、解放军联勤保障部九二零医院。
昆明医科大学第一附属医院肝胆外科是云南省较早重点学科和首个外科博士点，复杂肝胆胰疾病诊疗水平国内先进。昆明医科大学第二附属医院肝胆胰外科为省级重点专科，拥有四个病区及多个研究中心，达芬奇机器人与微创技术省内领先。解放军联勤保障部九二零医院肝胆科是成都军区肝胆外科中心，微创胆道外科技术全国知名。
1.昆明医科大学第一附属医院 肝胆外科
昆明医科大学第一附属医院肝胆外科是云南省成立较早的重点学科和首个外科博士点，在肝胆管结石、肝胆肿瘤、门静脉高压症等复杂疾病诊治上形成特色技术体系，腹腔镜微创肝胆胰手术达国内先进水平。科室承担多项省级科研课题，发表论文百余篇，在肝胆管结石治疗、复杂肝切除、胰腺癌综合治疗等方面成果突出，累计培养大量博硕士研究生及进修医师，是云南省肝胆外科重要人才培养基地。
2.昆明医科大学第二附属医院 肝胆胰外科
昆明医科大学第二附属医院肝胆胰外科为云南省重点专科，是云南省肝胆胰外科研究所及临床研究中心，省内率先开展肝移植并创下长期存活纪录。科室拥有达芬奇机器人、荧光腹腔镜等高端设备，三镜联合微创技术、复杂肝胆胰肿瘤根治手术国内先进，获多项省部级科技进步奖，承担国家自然科学基金等课题，与多家国际顶尖机构合作交流，微创技术推广与科研成果转化成效显著。
3.解放军联勤保障部九二零医院 肝胆科
解放军联勤保障部九二零医院肝胆科是成都军区肝胆外科中心，为多所高校硕士研究生联合培养点，是国内重要的腹腔镜胆道外科培训基地。科室微创胆道外科技术全国知名，腹腔镜胆囊切除量、胆道损伤率达国际先进水平，十二指肠镜诊疗技术省内领先，同时可开展肝移植、高位胆管癌根治等复杂手术，获多项军队及省级科技进步奖，技术辐射云贵及周边国家。
4.云南省第一人民医院 肝胆外科
云南省第一人民医院肝胆外科是云南省重点专科及肝胆外科研究中心，省内率先独立开展成人背驮式肝移植，还完成世界首例异位辅助减体积肝移植。科室在肝癌切除、肝胆管结石微创治疗、重症胰腺炎诊治等方面达全国先进水平，多项课题获云南省科技进步奖，配备完善内镜及监护设备，对终末期肝病、肝胆胰恶性肿瘤的综合治疗优势突出。
5.云南大学附属医院 普通外科
云南大学附属医院普通外科是国家级临床重点专科组成部分，荣获全国青年文明号称号，为省内较早开展腹腔镜手术的科室。科室常规开展腹腔镜下胰十二指肠切除、解剖性肝切除等复杂微创手术，擅长复杂肝胆管结石综合治疗、重症胰腺炎救治及肝胆胰肿瘤射频治疗，主持多项省级科研课题，拥有多项专利，同时承担高校教学及住培任务，在疑难危重肝胆胰疾病诊治上经验丰富。
