南宁心理咨询科医院排名比较靠前的是广西医科大学第一附属医院、南宁市第一人民医院、广西壮族自治区妇幼保健院。
广西医科大学第一附属医院心理卫生科科研实力强、开放病房起步早。南宁市第一人民医院心理咨询科治疗体系完整，可开展司法鉴定与系统心理干预。广西壮族自治区妇幼保健院心理咨询科专注妇幼人群，标准制定与设备水平全区领先。
1.广西医科大学第一附属医院 心理卫生科
广西医科大学第一附属医院心理卫生科是广西最早开设综合性医院开放式心理病房的机构，集临床、教学、科研于一体。科室主持国家自然科学基金等多项国家级课题，年均发表多篇SCI论文。在常见精神心理障碍、情绪问题、睡眠障碍诊疗方面经验丰富，区域示范作用突出。
2.南宁市第一人民医院 心理咨询科
南宁市第一人民医院心理咨询科是南宁影响力较强的综合性心理专科，拥有完善的心理治疗、评估、司法鉴定服务体系。开展个体、家庭、团体等全类型心理治疗，擅长抑郁症、焦虑症、精神分裂症、双相情感障碍及儿童青少年发育行为问题、成瘾行为等诊疗，心理测量项目全面，同时承担临床会诊与教学任务。
3.广西壮族自治区妇幼保健院 心理咨询科
广西壮族自治区妇幼保健院心理咨询科是国家级青少年心理健康项目省级管理单位，主导制定多项广西心理健康地方标准。设备与诊疗环境全区领先，多学科协作模式成熟，专注儿童青少年、孕产妇、更年期妇女心理保健与疾病治疗。科研成果丰硕，承担多项省级课题，服务规范、专业性强。
4.广西医科大学第二附属医院 心理卫生科
广西医科大学第二附属医院心理卫生科是广西卫健委临床重点专科、国家精神科规培基地，广西首家精神障碍航空救援单位。设睡眠、心身、儿童青少年、重性精神障碍四大亚专科，拥有先进物理治疗与睡眠监测设备，擅长心身疾病、睡眠障碍、青少年心理问题及难治性精神障碍的综合干预，科研教学实力突出。
5.广西医科大学附属武鸣医院 心理门诊
广西医科大学附属武鸣医院心理门诊按三甲标准建设，是区域内首家综合医院临床心理门诊，提供全生命周期精神心理服务。规范开展焦虑、抑郁、躯体化障碍、睡眠障碍、孤独症、多动症、抽动症及各类重性精神病诊疗，环境舒适保密，诊疗流程规范，年服务量大，覆盖范围广。
