浙江大学医学院附属第一医院擅长的科室有普通外科、肾内科、血液内科、感染内科、泌尿外科，科室专业技术过硬、设备配置先进，患者可根据自身情况选择对应科室就诊。
1、普通外科
在中国医院/中国医学院校科技量值（STEM）排名中，排名全国第一名，科室下设肝胆胰脾外科、胃肠外科、血管外科等亚专科，在终末期肝病、肾病、心脏、胰腺与大血管疾病等方面，都已形成了一体化综合诊治经验，通过技术创新不断解决一个个疑难重症，提高了疑难、危重病例的生存率。
2、肾内科
科室形成了“以肾移植为核心的尿毒症一体化治疗体系”，创建了全球最大的终末期肾病诊治中心，终末期肾病的长期生存率达到国际领先水平；在难治性肾病诊治和新型免疫抑制剂的合理应用、活体亲属肾移植和肾移植难治性排斥的诊治等领域取得了显著的成果。
3、血液内科
连续6年位居复旦专科声誉排行榜全国第五。目前已完成五十余项新药和新疗法临床研究，技术能力雄厚。血液系统恶性肿瘤特别是白血病的诊治方面在全国位居前列，学科专注于白血病等严重危害人类健康的血液肿瘤防治和转化研究。
4、感染内科
是国内规模最大、学术水平领先的感染病教学、科研和临床基地之一，科室收治病种齐全，病人来源广泛。在病毒性肝炎等重大传染病和新型流感等新发突发传染病诊治方面取得重大突破。
5、泌尿外科
是国家临床重点专科，浙江省医学重点学科，浙江省医学支撑学科，浙江省中西医结合前列腺病学重点学科。该科技术实力雄厚、医疗设备先进。该科室在疑难杂病的诊治在国内独树一帜，创新发展了机器人辅助腹腔镜手术、尿路结石的诊治等，治疗效果达到国内先进水平。
除此之外，浙江大学医学院附属第一医院的超声科、药剂科、全科医疗科也拥有高超的诊疗技术，为患者就医提供可靠基础和保障。