昆明肾病医院好的有昆明医科大学第一附属医院、昆明医科大学第二附属医院、解放军联勤保障部九二零医院等。其中昆明医科大学第一附属医院肾脏内科，荣获云南省首批临床重点专科，为云南省肾脏病学继续医学教育培训基地。昆明医科大学第二附属医院肾脏内科为云南省肾脏病临床重点专科，是省内具影响力的腹膜透析中心。解放军联勤保障部九二零医院肾脏内科是云南省最早成立的肾脏病专科之一。
第一名：昆明医科大学第一附属医院-肾脏内科
昆明医科大学第一附属医院肾脏内科，荣获云南省首批临床重点专科、卫生部腹膜透析培训示范中心培育单位、云南省肾病和血液净化质量控制中心、云南省血液透析技术临床培训基地、云南省肾脏病学继续医学教育培训基地、云南省住院医师规范化培训基地。主持及参与国家级、省部级、厅级科研项目30余项，发表SCI论文40余篇，多人次获省科技成果及省卫生科技成果二、三等奖。
第二名：昆明医科大学第二附属医院-肾脏内科
昆明医科大学第二附属医院肾脏内科目前已发展为集肾脏疾病临床诊疗、血液净化、教学、科研、预防保健为一体的云南省肾脏病临床重点专科。开展多种血液净化治疗模式及透析通路维护，率先在省内开展分子吸附再循环治疗，血透通路手术参加全国大赛分别获得一、二、三等奖，是省内具影响力的腹膜透析中心。
第三名：解放军联勤保障部九二零医院-肾脏内科
解放军联勤保障部九二零医院肾脏内科是云南省最早成立的肾脏病专科之一。科室主要收治各种原发性和继发性肾脏疾病、肾间质疾病、急慢性肾功能衰竭以及药物、毒物中毒和各种风湿免疫疾病，同时该科还承担了第三、第四军医大学、昆明医学院、大理医学院及省、市卫校的临床理论教学和实习工作。
第四名：云南省第一人民医院-肾脏内科
云南省第一人民医院肾脏内科是云南省卫生厅以及云南省政府授予的”青年文明号”科室，是云南省最早独立设置的肾疾病专业科室之一。1995年成立血液净化中心，先后引进德国费森尤斯、美国百特、瑞典金宝等知名公司的先进血液净化仪十余台。
第五名：安宁市第一人民医院-肾内科
安宁市第一人民医院肾内科，拥有德国全进口的劳尔30床双极反渗水处理设备一套，费森尤斯血液透析机10台，百特床旁持续性血液净化机1台。2010年通过了云南省卫生厅第二批次血液透析室执业登记和技术准入，属云南省允许开展血液透析的66家医疗机构之一。开展了血液透析、高通量血液透析、血液透析滤过、血液灌流、持续性床旁血液净化、序贯透析、单纯超滤等多种透析技术方式。
第六名：云南省第三人民医院-肾病内科
云南省第三人民医院肾病内科，是省院共建临床重点专科，是国家肾脏疾病临床医学研究中心成员单位、国家药物临床试验基地，大理大学硕士点。在肾脏疾病临床诊治、血液透析、腹膜透析、血浆置换、人工肝治疗等方面形成显著的临床特色。
第七名：昆明市延安医院-肾内科
昆明市延安医院肾内科是云南省肾脏病学临床重点医学专科、云南省血液透析专科培训基地、云南省慢性肾病临床医学研究中心核心单位、昆明市肾病与血液透析医疗质量控制中心、昆明市肾病医防融合诊疗中心、昆明市肾小球疾病诊疗中心。荣获云南省科技进步三等奖2项，昆明市科技进步二等奖2项，三等奖2项。在国家和省级医学杂志上共发表医学论文100余篇，SCI收录4篇，主编专著5部。