首都医科大学附属北京安贞医院擅长心外科、心血管内科、精神科、胸外科、普外科。科室专业技术过硬、设备配置先进、治疗水平高超。
1、心外科
在复旦专科声誉排行榜中位列第二，是全国最早独立成科的心外科专业科室，在治疗的先进性、全面性、多样性等多方面的综合实力也位居国内前列。主动脉内球囊反搏收治量超过500例/年，为世界领先。
2、心血管内科
是全国心血管疑难危重疾病的诊治中心之一，中心设有冠心病组、心律失常组、结构性心脏病组、高血压组、心力衰竭组等亚专科组，擅长各种心血管疾病的诊治，其冠心病治疗水平一直处于全国领先地位。
3、精神科
为三甲医院专门从事精神心理卫生服务的临床一级科室。科室拥有国内外常用的各种心理评估工具，从客观的角度评估患者的心理状态。科室还结合了安贞医院特点，开展“双心医学”实践，为心血管病合并精神障碍患者提供绿色通道。
4、胸外科
率先成功地进行了我国第一例单肺移植和双肺移植，主要收治肺、食管、贲门、纵隔、横膈及胸壁疾病的患者。针对肺癌患者存在特色治疗方案，可根据病人标本进行基因检测，选择适当的化疗药物和靶向药物进行辅助化疗，以及针对肺癌晚期患者采用气管内肿瘤冷冻和恶性胸水介入治疗和热灌注化疗等综合措施，进一步延长患者的生命。
5、普外科
是国内最早期开展腹腔镜微创手术的单位之一，在乳腺甲状腺肿瘤微创外科、胃肠肝胆胰肿瘤微创外科、肥胖减重及糖尿病代谢疾病微创手术以及合并心肺疾病的普外科疾病手术等四方面，具有国内鲜明的医疗特色。
