治疗室间隔缺损建议就诊于心脏内科，上海治疗室间隔缺损排名靠前的医院分别为复旦大学附属中山医院心内科、上海交通大学医学院附属瑞金医院心内科、复旦大学附属华山医院心内科。其中复旦大学附属中山医院心内科拥有两院院士，科研与诊疗水平国内领先；上海交通大学医学院附属瑞金医院心内科专科排名全国前十，科研成果丰硕；复旦大学附属华山医院心内科是全国首批重点学科，中西医结合特色鲜明。
1、复旦大学附属中山医院 心内科
复旦大学附属中山医院心内科是教育部重点学科、国家临床重点专科，拥有中国科学院、工程院院士各1名，国家杰出青年基金获得者2名。学科斩获国家科技进步奖2项、国家技术发明奖1项，近5年发表SCI论文115篇，拥有多项特色技术，在复杂冠脉病变、室间隔缺损、瓣膜病介入等领域处于国内领先，修正传统治疗方法并录入国内外教科书，牵头多项临床研究，是上海市心血管病临床质控中心，综合实力稳居国内前列。
2、上海交通大学医学院附属瑞金医院 心内科
上海交通大学医学院附属瑞金医院心内科是国家重点学科、国家临床重点专科，专科排名全国前十，牵头制定多项国家诊疗指南和专家共识。学科配备国际先进设备，年介入手术量超10000例，近十年获国家自然科学基金100项以上，近5年发表SCI论文185篇，累计影响因子800多分，获国家科技进步二等奖及省部级奖励10多项，科研与临床实力雄厚。
3、复旦大学附属华山医院 心内科
复旦大学附属华山医院心内科是全国首批重点学科，国家科委、卫生部指定的国家级新药评审中心。学科开创中西医结合治疗冠心病特色，研制家喻户晓的麝香保心丸，获国家科技大会二等奖等多项荣誉，是国内最早开展冠心病介入治疗的中心之一，近3年发表SCI论文30余篇，承担多项国家自然科学基金课题，临床与科研特色突出。
4、上海交通大学医学院附属仁济医院 心内科
上海交通大学医学院附属仁济医院心内科是国家临床重点专科、教育部国家重点学科，国家首批冠脉介入培训基地、国家级胸痛中心。学科亚专科齐全，年介入手术量国内名列前茅，疑难危重冠脉介入等领域处于国内领先，承担国家科技部重点研发计划等50多项课题，研究成果写入国际指南，发表于心血管领域顶级期刊，学术影响力突出。
5、上海交通大学医学院附属第九人民医院 心血管内科
上海交通大学医学院附属第九人民医院心血管内科是全国心脏介入影像培训中心、房颤中心示范基地，上海首批胸痛中心。学科常规开展各类复杂介入手术，左心耳封堵术开展量居上海前列，近五年获国家自然科学基金11项，发表SCI论文90篇，获发明专利8项，牵头多项国内多中心临床研究，在房颤综合治疗、精准PCI等领域特色鲜明，诊疗水平先进。
