深圳肛肠科医院排名靠前的是深圳市人民医院肛肠外科、深圳市第三人民医院外科、深圳市第二人民医院肛肠外科等。深圳市人民医院肛肠外科是深圳三甲综合医院中率先实践肛门疾病一体化诊疗服务的科室，年门诊量2万余人次，年手术量2千余台；深圳市第三人民医院外科擅长外科常见病、多发病、疑难病的诊治，可处理与肛肠相关的腹腔盆腔类疾病；深圳市第二人民医院肛肠外科设备先进，拥有多种肛肠微创疗法，近5年公开发表学术论文20余篇。
1、深圳市人民医院 肛肠外科
该科室1996年开设专科门诊，2006年成立肛肠外科病区，是深圳三甲综合性医院中率先实践肛门疾病一体化诊疗服务的科室。科室年门诊量2万余人次，年手术量2千余台，转诊复杂病例占患者总数30%。科室遵循国际公认治疗原则，优先选用成熟微创技术，痔病多采用痔胶圈套扎治疗，采用多模式预先镇痛方案，可将绝大多数患者术后疼痛控制在微痛水平。科室配备专人负责出院后康复延续服务，自2001年起每年举办深圳市肛肠外科研讨会，开设手术开放日，每周二手把手培训市内其他医院青年肛肠医师，推动区域肛肠外科技术发展与人才培养。
2、深圳市第三人民医院 外科
该科室擅长外科常见病、多发病、疑难病的诊治，在骨结核病、肝囊肿、慢性阑尾炎、胆囊炎等疾病方面具备显著诊疗优势，可处理易引发肛肠不适的腹腔原发病，辅助处理肛肠相关交叉复杂病症。科室依托完善的综合外科诊疗平台，具备成熟的术前评估、手术操作、术后抗感染及康复管理体系，能够为合并腹腔脏器病变的肛肠疾病患者开展联合诊疗。科室拥有重症救治与感染管控能力，可为高龄、伴有多种基础疾病的肛肠疾病患者降低手术风险，保障诊疗安全，处理肛肠疾病合并其他外科疾病的复合病例。
3、深圳市第二人民医院 肛肠外科
该科室配备德国经肛门直肠肿瘤微创切除系统、肛肠动力学检测系统、超声刀等先进设备，可诊治痔、肛瘘、肛周脓肿、直肠脱垂、慢性便秘、炎性肠病及结直肠良恶性肿瘤。科室主打无痛微创技术，开展TST、HAL、消痔灵硬化注射等多种特色微创术式，结合中医疗法，从心理、饮食、理疗、手术多维度制定个体化方案。科室承担多项国家级、省市级科研项目，承担深圳大学医学院教学工作，培养多名硕士研究生，近5年发表学术论文20余篇。
4、中山大学附属第八医院 肛肠分院
该科室是深圳市唯一一家公立肛肠专科医院，同时为中山大学教学医院、肛肠外科硕士研究生培养基地。科室下设三大肛肠专科病区、专病门诊、功能检查中心、专科制剂室、肛肠外科研究室等配套部门，配备经肛门直肠显微手术系统、肛管直肠测压系统等先进设备，由李一兵教授担任学科带头人。分院是“中华肛肠外科网”主任委员单位，是我国东南地区特色中西医结合肛肠专科，可完成全部肛肠外科手术，年收治住院病人4000至5000人次，多项诊疗技术全国领先。
5、中山大学附属第七医院 普外科
该科室设置肝胆胰脾外科、甲状腺乳腺外科两个亚专科，是集医疗、教学、科研于一体的外科科室。科室以患者为中心，采用MDT多学科联合诊治模式，打造快速康复外科与无痛病房。科室门诊、住院、手术量位居医院前列，可开展常规、腔镜、机器人、介入及消融手术，完成精准肝切除、胰十二指肠切除术、乳腺癌根治与乳房重建、甲状腺癌颈部淋巴结清扫等高难度手术。科室可开展腹腔镜、微波消融、ERCP取石等微创技术，独创隐疤腹腔镜胆囊切除术，肝胆胰与甲乳机器人手术逐年增多，能够处理盆腔脏器合并肛肠相关的复合型外科疾病，提供一站式综合诊疗。
